31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1062 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1062  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  318  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.836162  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19371  hypothetical protein  99.41 
 
 		 170 aa  317  6e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14811  hypothetical protein  66.05 
 
 		 173 aa  211  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686917  normal  0.0260683 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12401  hypothetical protein  65.54 
 
 		 172 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  58.39 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  56.21 
 
 		 170 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0041  hypothetical protein  68.61 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  59.12 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  56.6 
 
 		 170 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0036  hypothetical protein  63.51 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00391  hypothetical protein  62.07 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  28.86 
 
 		 383 aa  63.9  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  32.45 
 
 		 384 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  29.76 
 
 		 343 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  33.33 
 
 		 389 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  31.91 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  25 
 
 		 349 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  30.07 
 
 		 342 aa  44.3  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1670  putative ammonia monooxygenase-like protein  31.11 
 
 		 345 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  28.4 
 
 		 348 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  28.4 
 
 		 348 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  28.4 
 
 		 348 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  28.4 
 
 		 348 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  30.67 
 
 		 362 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0804  protein AbrB  28.4 
 
 		 348 aa  41.6  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  28.47 
 
 		 352 aa  41.6  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  28.4 
 
 		 348 aa  41.2  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  28.4 
 
 		 348 aa  41.2  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1451  hypothetical protein  29.25 
 
 		 402 aa  40.8  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  26.39 
 
 		 358 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  27.03 
 
 		 338 aa  40.8  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>