31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0041 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0041  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  320  6e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0036  hypothetical protein  83.12 
 
 
177 aa  222  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  70.81 
 
 
170 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  69.62 
 
 
170 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  71.7 
 
 
170 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  70.81 
 
 
170 aa  214  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14811  hypothetical protein  66.06 
 
 
173 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686917  normal  0.0260683 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1062  hypothetical protein  66.25 
 
 
170 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.836162  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00391  hypothetical protein  80.79 
 
 
171 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19371  hypothetical protein  65.62 
 
 
170 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12401  hypothetical protein  61.18 
 
 
172 aa  180  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  30.15 
 
 
383 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  35.46 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  30.58 
 
 
338 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  33.03 
 
 
342 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  33.53 
 
 
343 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  29.82 
 
 
349 aa  47.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  32.77 
 
 
384 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  32.12 
 
 
348 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  31.52 
 
 
348 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  31.52 
 
 
348 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  31.52 
 
 
348 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  31.52 
 
 
348 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1096  hypothetical protein  26.92 
 
 
361 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402097  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  27.4 
 
 
342 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  31.52 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0804  protein AbrB  31.52 
 
 
348 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54374  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0631  protein AbrB  30.91 
 
 
348 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0720  putative ammonia monooxygenase  31.33 
 
 
347 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.716088  normal  0.227545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  35.92 
 
 
355 aa  40.8  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4903  putative ammonia monooxygenase  30.09 
 
 
397 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.080717  normal  0.221223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>