44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0720 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0720  putative ammonia monooxygenase  100 
 
 		 347 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.716088  normal  0.227545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2134  putative ammonia monooxygenase  54.28 
 
 		 339 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0572  hypothetical protein  35.42 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0543  membrane protein AbrB duplication  28.31 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0626  putative ammonia monooxygenase  29.52 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1096  hypothetical protein  26.84 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402097  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0301  putative ammonia monooxygenase  28.48 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0363814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0495  putative ammonia monooxygenase  28.32 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0330  putative ammonia monooxygenase  27.97 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  28.63 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  26.83 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  26.75 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  26.96 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0631  protein AbrB  28.49 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  28.41 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  28.41 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  28.41 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  28.41 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  28.41 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0804  protein AbrB  27.84 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54374  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  27.84 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  24.32 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1961  putative ammonia monooxygenase  28.47 
 
 		 369 aa  52.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  24.85 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1768  membrane protein AbrB duplication  25.22 
 
 		 366 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  24.31 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0442  putative ammonia monooxygenase  28.18 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  25 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  25.33 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3407  membrane protein AbrB duplication  31.21 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2810  membrane protein AbrB duplication  28.1 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  31.52 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0824  hypothetical protein  25.33 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0853  hypothetical protein  24.41 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  hitchhiker  0.00000634184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0763  protein AbrB  24.41 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.518292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0886  protein AbrB  24.41 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.429214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0789  ammonia monooxygenase  24.41 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.973057  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0324  putative ammonia monooxygenase  24.14 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4953  putative ammonia monooxygenase  25.41 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365328  normal  0.422163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  24.66 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0549  membrane protein AbrB duplication  27.52 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0967394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  24.65 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  23.01 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  23.77 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>