31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1670 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1670  putative ammonia monooxygenase-like protein  100 
 
 		 345 aa  629  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  27.3 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  27.97 
 
 		 383 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  27.41 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3740  membrane protein AbrB duplication  28.19 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.775905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  33.94 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  34.34 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1768  membrane protein AbrB duplication  35.29 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1270  putative ammonia monooxygenase  33.91 
 
 		 374 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  31.69 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0442  putative ammonia monooxygenase  31.13 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3432  putative ammonia monooxygenase  28.39 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5251  membrane protein AbrB duplication  33.77 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0629  membrane protein AbrB duplication  34.67 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  27.76 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0727  membrane protein AbrB duplication  31.94 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  30.99 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0549  membrane protein AbrB duplication  35.83 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0967394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  31.58 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  27.76 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  34.48 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12401  hypothetical protein  31.01 
 
 		 172 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  35.86 
 
 		 162 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  29.89 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0543  membrane protein AbrB duplication  25.82 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  27.71 
 
 		 170 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  26.67 
 
 		 170 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1062  hypothetical protein  31.11 
 
 		 170 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.836162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  26.43 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19371  hypothetical protein  31.11 
 
 		 170 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  26.06 
 
 		 170 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>