More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3679 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5912  ketol-acid reductoisomerase  89.66 
 
 		 347 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3679  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 348 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0977362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1923  ketol-acid reductoisomerase  80.58 
 
 		 347 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.251199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2039  ketol-acid reductoisomerase  67.05 
 
 		 352 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.580971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3478  ketol-acid reductoisomerase  63.79 
 
 		 366 aa  474  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02480  ketol-acid reductoisomerase, putative  61.74 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02526  acetohydroxyacid reductoisomerase (Eurofung)  60.64 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.210486 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78299  mitochondrial ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  41.73 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  37.13 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  36.94 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1608  ketol-acid reductoisomerase  35.19 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000345501  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30967  predicted protein  32.51 
 
 		 539 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  37.85 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  37.85 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  37.23 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  41.02 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  37.54 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  37.54 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  37.54 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  37.54 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  37.54 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  41.41 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  37.23 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  41.41 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  37.23 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  41.41 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  34.77 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  42.35 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  36.56 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1722  ketol-acid reductoisomerase  35.81 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.801354  normal  0.0124349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  35.49 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  38.98 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  37.8 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  34.36 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  41.11 
 
 		 336 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  34.57 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1641  ketol-acid reductoisomerase  36.62 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.75245  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  36.75 
 
 		 330 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  35.69 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  35.46 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  36.62 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0481  ketol-acid reductoisomerase  36.81 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  37.4 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1178  ketol-acid reductoisomerase  40.87 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1175  ketol-acid reductoisomerase  39.15 
 
 		 329 aa  167  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  34.36 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  34.57 
 
 		 344 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  36.31 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  33.54 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1755  ketol-acid reductoisomerase  37.59 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  33.03 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  36.52 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  37.68 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  35.42 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  36.18 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  35.73 
 
 		 341 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  37.55 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  33.85 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  36.76 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  35.15 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  37.15 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  33.03 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  34.47 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  31.58 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0082  ketol-acid reductoisomerase  35.83 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.562426  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30575  predicted protein  32.22 
 
 		 546 aa  159  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  37.15 
 
 		 331 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  34.15 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1541  ketol-acid reductoisomerase  36.14 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  36.36 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  36.36 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  35.83 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  31.79 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0552  ketol-acid reductoisomerase  36.49 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00831363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  34.67 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  33.1 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  35.56 
 
 		 331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  36 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  36.31 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  35.97 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  36.31 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  32.2 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  31.9 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  38.74 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  32.41 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  34.66 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  36.61 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  36.22 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  33.83 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  34.88 
 
 		 332 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1927  ketol-acid reductoisomerase  35.82 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  37 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  36.69 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  36.69 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  34.77 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  34.77 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0019  hypothetical protein  31.68 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  35.97 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02605  ketol-acid reductoisomerase  33.86 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>