More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF02480 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF02480  ketol-acid reductoisomerase, putative  100 
 
 
401 aa  828    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02526  acetohydroxyacid reductoisomerase (Eurofung)  69.23 
 
 
400 aa  568  1e-161  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.210486 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78299  mitochondrial ketol-acid reductoisomerase  69.02 
 
 
399 aa  545  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5912  ketol-acid reductoisomerase  60.4 
 
 
347 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1923  ketol-acid reductoisomerase  60.4 
 
 
347 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.251199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3679  ketol-acid reductoisomerase  61.74 
 
 
348 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0977362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2039  ketol-acid reductoisomerase  57.59 
 
 
352 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.580971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3478  ketol-acid reductoisomerase  58.31 
 
 
366 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  39.86 
 
 
331 aa  195  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  36.28 
 
 
330 aa  192  8e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1608  ketol-acid reductoisomerase  35.65 
 
 
335 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000345501  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1722  ketol-acid reductoisomerase  36.87 
 
 
328 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.801354  normal  0.0124349 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1755  ketol-acid reductoisomerase  42.26 
 
 
328 aa  188  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  35.71 
 
 
330 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  41.35 
 
 
341 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  35.22 
 
 
335 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  34.81 
 
 
330 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  37.58 
 
 
330 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  36.95 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1541  ketol-acid reductoisomerase  36.12 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  33.14 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0552  ketol-acid reductoisomerase  41.09 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00831363 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  36.95 
 
 
336 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  40.6 
 
 
341 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  38.13 
 
 
330 aa  183  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  33.93 
 
 
340 aa  182  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30967  predicted protein  30.88 
 
 
539 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  35.26 
 
 
335 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  35.61 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  36.28 
 
 
332 aa  180  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  35.2 
 
 
330 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  35.48 
 
 
329 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1641  ketol-acid reductoisomerase  39.84 
 
 
335 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.75245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  36.26 
 
 
336 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  37.25 
 
 
331 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  33.53 
 
 
340 aa  179  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  34.04 
 
 
341 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  34.16 
 
 
340 aa  178  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  36.55 
 
 
336 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0959  ketol-acid reductoisomerase  33.13 
 
 
332 aa  178  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00572985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0082  ketol-acid reductoisomerase  37.27 
 
 
331 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.562426  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  34.51 
 
 
332 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  38.49 
 
 
338 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  36.26 
 
 
336 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  36.26 
 
 
336 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  38.02 
 
 
331 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  33.04 
 
 
336 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  35.96 
 
 
336 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  33.74 
 
 
340 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  36.26 
 
 
336 aa  176  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  36.2 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  35.96 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  39.29 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  35.96 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  36.96 
 
 
327 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  35.67 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  35.96 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  40.87 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  40.67 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  34.05 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  35.88 
 
 
329 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  38.99 
 
 
344 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1175  ketol-acid reductoisomerase  40.31 
 
 
329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  33.33 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  33.73 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  38.98 
 
 
330 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  33.83 
 
 
340 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  33.14 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  34.88 
 
 
330 aa  172  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  37.8 
 
 
333 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  33.94 
 
 
338 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  39.29 
 
 
338 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  35.47 
 
 
333 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  36.63 
 
 
336 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  40.94 
 
 
331 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  33.43 
 
 
340 aa  171  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  41.57 
 
 
330 aa  170  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  34.46 
 
 
334 aa  169  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  39.31 
 
 
331 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  37.46 
 
 
338 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  37.46 
 
 
338 aa  169  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  34.37 
 
 
329 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  32.22 
 
 
338 aa  169  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  32.52 
 
 
338 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  33.23 
 
 
331 aa  169  9e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  33.64 
 
 
338 aa  169  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  32.56 
 
 
340 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  33.13 
 
 
338 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  37.68 
 
 
331 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  34.37 
 
 
329 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  37.59 
 
 
338 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1178  ketol-acid reductoisomerase  39.46 
 
 
326 aa  168  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  34.38 
 
 
331 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  32.52 
 
 
338 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  32.52 
 
 
338 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  33.53 
 
 
331 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  32.91 
 
 
331 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  32.52 
 
 
338 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  37.07 
 
 
347 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  36.86 
 
 
338 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>