More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2039 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2039  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 352 aa  723    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.580971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3478  ketol-acid reductoisomerase  70.54 
 
 		 366 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1923  ketol-acid reductoisomerase  70.03 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.251199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5912  ketol-acid reductoisomerase  67.05 
 
 		 347 aa  482  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3679  ketol-acid reductoisomerase  67.05 
 
 		 348 aa  455  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0977362 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02480  ketol-acid reductoisomerase, putative  57.59 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02526  acetohydroxyacid reductoisomerase (Eurofung)  56.2 
 
 		 400 aa  411  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.210486 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78299  mitochondrial ketol-acid reductoisomerase  57.76 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1608  ketol-acid reductoisomerase  36.73 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000345501  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30967  predicted protein  33.14 
 
 		 539 aa  179  9e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  38.08 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  35.05 
 
 		 336 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  36.39 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  35.03 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1957  ketol-acid reductoisomerase  37.76 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  35.14 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  39 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  36.07 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  36.07 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  34.53 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  39.76 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  41.5 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  35.31 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  36.04 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  34.43 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  38.55 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1641  ketol-acid reductoisomerase  38.81 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.75245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  35.08 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  38.01 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  39.53 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  33.83 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  39.25 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1722  ketol-acid reductoisomerase  34.65 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.801354  normal  0.0124349 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1755  ketol-acid reductoisomerase  36.65 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  37.66 
 
 		 329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  34.26 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  33.95 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  33.92 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30575  predicted protein  31.56 
 
 		 546 aa  162  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  38.85 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  34.46 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  38.85 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  34.46 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0903  ketol-acid reductoisomerase  35.09 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  38.85 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  35.94 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  38.85 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1175  ketol-acid reductoisomerase  39.15 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  39.23 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  38.46 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  38.85 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0082  ketol-acid reductoisomerase  36.31 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.562426  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  34.73 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  36.49 
 
 		 330 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0019  hypothetical protein  34.16 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  36.09 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  34.46 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  37.69 
 
 		 336 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  37.15 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  32.93 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1178  ketol-acid reductoisomerase  34.66 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0959  ketol-acid reductoisomerase  37.64 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00572985 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  34.86 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  37.79 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  32.62 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  31.52 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0481  ketol-acid reductoisomerase  35.05 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  33.84 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1541  ketol-acid reductoisomerase  33.54 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  33.53 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  34.43 
 
 		 331 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  34.04 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  37.11 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  37.11 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  32.66 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0552  ketol-acid reductoisomerase  38.11 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00831363 
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  33.53 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1107  ketol-acid reductoisomerase  33.33 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02605  ketol-acid reductoisomerase  34.67 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  31.27 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  30.96 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  34.56 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  34.56 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  31.89 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2654  ketol-acid reductoisomerase  34.06 
 
 		 344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  35.33 
 
 		 331 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  36.02 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  37.15 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  37.15 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0708  ketol-acid reductoisomerase  36.25 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  37.15 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  33.74 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  30.46 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  31.31 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0290  ketol-acid reductoisomerase  36.42 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.233304 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1201  ketol-acid reductoisomerase  33.33 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.460879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  36 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  35.25 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  36.33 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  36.3 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>