99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2876 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2876  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  719    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1193  hypothetical protein  91.62 
 
 
357 aa  627  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3048  hypothetical protein  91.84 
 
 
358 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1283  hypothetical protein  92.15 
 
 
358 aa  624  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.81326  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2457  hypothetical protein  80.67 
 
 
358 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2556  putative sugar ABC transporter  80.11 
 
 
358 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3029  hypothetical protein  80.39 
 
 
358 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000284319  normal  0.0136248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2370  hypothetical protein  78.65 
 
 
357 aa  575  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1137  hypothetical protein  80.17 
 
 
354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1740  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.96 
 
 
372 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0845  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.35 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0909  methylthioribose-binding protein  39.18 
 
 
370 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0665  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.35 
 
 
370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0661  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  35.56 
 
 
370 aa  232  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0636  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.94 
 
 
354 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000233808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2340  ABC transporter binding protein  34.38 
 
 
351 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0518238  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2579  ABC transporter substrate-binding protein  30.6 
 
 
344 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4828  putative sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  32.9 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0277486  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5886  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.43 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.651755 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6148  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  29.71 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0762309  hitchhiker  0.00309202 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6563  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.25 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0517  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  33.44 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2580  ABC transporter substrate-binding protein  31.27 
 
 
345 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0840198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0404  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  30.31 
 
 
368 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5162  ABC transporter binding protein  30.89 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5159  ABC transporter binding protein  34.59 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.535798  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6576  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.82 
 
 
356 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807047  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1256  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.82 
 
 
356 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.307544  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6181  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.82 
 
 
356 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2877  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.23 
 
 
334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475569  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2996  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  30.72 
 
 
334 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43630  periplasmic sugar binding protein  30.89 
 
 
328 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0314584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2996  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.98 
 
 
323 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.809705  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2995  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.68 
 
 
342 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.700398  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5972  rbsB; ABC transporter substrate binding protein (ribose)  32.65 
 
 
337 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1513  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.27 
 
 
521 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2757  sugar-binding protein, putative  30.2 
 
 
323 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1426  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.62 
 
 
336 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134002  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0135  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  29.27 
 
 
338 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2758  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  29.35 
 
 
342 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0414  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  29.27 
 
 
336 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1166  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  29.27 
 
 
336 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43620  ribose ABC transporter  30.12 
 
 
335 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0182793  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6459  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.24 
 
 
337 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0427942  normal  0.0971645 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2365  ABC sugar (ribose) transporter, periplasmic substrate-binding subunit  31.96 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.96 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5165  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  30.92 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2406  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.62 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362363  normal  0.524454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2724  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.32 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4173  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.4 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0023  ABC transporter ATP-binding protein  27.23 
 
 
875 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1857  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.66 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  hitchhiker  0.00271003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3042  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.62 
 
 
315 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1916  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.06 
 
 
386 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0176531  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4318  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.53 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.88 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0266  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein ABC transporter  26.29 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3673  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.19 
 
 
320 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.475948  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0612  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.31 
 
 
326 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  22.83 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2183  D-ribose-binding protein  26.79 
 
 
254 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4006  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.23 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3640  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.34 
 
 
311 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2124  Monosaccharide-transporting ATPase  26 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2801  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.78 
 
 
310 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2298  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.88 
 
 
345 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211923  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1193  putative ABC transporter  27.22 
 
 
370 aa  49.3  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4654  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.54 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.995284  normal  0.589042 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4780  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.22 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462835  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3001  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.18 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0363  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.96 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879984  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0964  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.19 
 
 
320 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4759  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.89 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125335  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6100  carbohydrate binding protein  23.37 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2242  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.75 
 
 
321 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.853779  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.84 
 
 
309 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00405542  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  23.23 
 
 
307 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6094  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.17 
 
 
323 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1871  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.49 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3526  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.44 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6851  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.89 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4058  monosaccharide-binding protein  22.9 
 
 
399 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0398  periplasmic sugar binding protein-like protein  25.23 
 
 
365 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00152665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  25.46 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1831  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.46 
 
 
309 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3049  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding, putative  25.54 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00910782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2595  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.59 
 
 
374 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3770  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.76 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.741987  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4864  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  31.11 
 
 
321 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4154  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.75 
 
 
329 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377851  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4112  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein ABC transporter  30.93 
 
 
340 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0987  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.27 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7477  sugar ABC transporter  26.21 
 
 
345 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  24.73 
 
 
331 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5319  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.87 
 
 
315 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0693893  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4540  ABC transporter substrate-binding protein  26.32 
 
 
344 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2603  twin-arginine translocation pathway signal  21.32 
 
 
338 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.912871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2009  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.6 
 
 
325 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  30.59 
 
 
146 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>