68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2457 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2457  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2556  putative sugar ABC transporter  99.44 
 
 		 358 aa  714    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3029  hypothetical protein  99.72 
 
 		 358 aa  716    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000284319  normal  0.0136248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3048  hypothetical protein  85.59 
 
 		 358 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1283  hypothetical protein  85.29 
 
 		 358 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.81326  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1193  hypothetical protein  84.66 
 
 		 357 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1137  hypothetical protein  80.62 
 
 		 354 aa  568  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2370  hypothetical protein  77.37 
 
 		 357 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2876  hypothetical protein  84.11 
 
 		 358 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1740  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.51 
 
 		 372 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0845  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.87 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0909  methylthioribose-binding protein  38.92 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0665  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.68 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0661  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  38.92 
 
 		 370 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0636  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.14 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000233808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2340  ABC transporter binding protein  31.45 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0518238  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4828  putative sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  32.44 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0277486  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6148  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  28.88 
 
 		 348 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0762309  hitchhiker  0.00309202 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6563  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.56 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5886  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.4 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.651755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0517  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  32.37 
 
 		 346 aa  135  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2579  ABC transporter substrate-binding protein  27.8 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0404  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  28.98 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2580  ABC transporter substrate-binding protein  29.31 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840198 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5162  ABC transporter binding protein  29.34 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6576  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.89 
 
 		 356 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1256  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.89 
 
 		 356 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.307544  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6181  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.01 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5159  ABC transporter binding protein  28.57 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.535798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2877  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.58 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475569  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2996  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  34.58 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43630  periplasmic sugar binding protein  30.83 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0314584  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5972  rbsB; ABC transporter substrate binding protein (ribose)  32 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2996  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.99 
 
 		 323 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.809705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6459  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.64 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0427942  normal  0.0971645 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1513  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.47 
 
 		 521 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2757  sugar-binding protein, putative  30.17 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1426  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.47 
 
 		 336 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134002  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0414  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  30.47 
 
 		 336 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0135  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  30.47 
 
 		 338 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366053  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1166  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  30.47 
 
 		 336 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2995  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.34 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.700398  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43620  ribose ABC transporter  29.96 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0182793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2758  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  28.93 
 
 		 342 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.08 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2365  ABC sugar (ribose) transporter, periplasmic substrate-binding subunit  31.08 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5165  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  31.44 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2724  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.23 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0023  ABC transporter ATP-binding protein  29.17 
 
 		 875 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2406  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.31 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362363  normal  0.524454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4173  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.5 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3640  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.18 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2183  D-ribose-binding protein  26.4 
 
 		 254 aa  49.7  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3042  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.24 
 
 		 315 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1916  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.99 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0176531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.39 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4318  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.53 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2298  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.01 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211923  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0612  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.1 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1857  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.04 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  hitchhiker  0.00271003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3673  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.29 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.475948  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0266  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein ABC transporter  23.68 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3320  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.12 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0964  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.69 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2825  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.99 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3269  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.67 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0363  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.5 
 
 		 318 aa  43.5  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879984  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0113  putative ABC-type sugar transport system  24.53 
 
 		 331 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>