More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1166 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0135  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  100 
 
 
338 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366053  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0414  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  100 
 
 
336 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1513  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
521 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1426  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  99.4 
 
 
336 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134002  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1166  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  100 
 
 
336 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0023  ABC transporter ATP-binding protein  96.84 
 
 
875 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2996  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  65.95 
 
 
334 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2877  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  66.31 
 
 
334 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475569  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2365  ABC sugar (ribose) transporter, periplasmic substrate-binding subunit  64.91 
 
 
320 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6459  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  63.42 
 
 
337 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0427942  normal  0.0971645 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  64.91 
 
 
320 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5972  rbsB; ABC transporter substrate binding protein (ribose)  63.82 
 
 
337 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43630  periplasmic sugar binding protein  64.18 
 
 
328 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0314584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2757  sugar-binding protein, putative  60.61 
 
 
323 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2996  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  62.37 
 
 
323 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.809705  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43620  ribose ABC transporter  61.32 
 
 
335 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0182793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2995  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  58.44 
 
 
342 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.700398  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5165  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  61.84 
 
 
337 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2758  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  58.12 
 
 
342 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4173  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  57.8 
 
 
317 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2724  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.72 
 
 
327 aa  219  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1740  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.02 
 
 
372 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0845  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.65 
 
 
381 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2876  hypothetical protein  29.27 
 
 
358 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0665  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.32 
 
 
370 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0661  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  29.32 
 
 
370 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0612  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.08 
 
 
326 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0909  methylthioribose-binding protein  29.32 
 
 
370 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2370  hypothetical protein  31.07 
 
 
357 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1193  hypothetical protein  29.27 
 
 
357 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2556  putative sugar ABC transporter  30.47 
 
 
358 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1283  hypothetical protein  29.02 
 
 
358 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.81326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3048  hypothetical protein  28.57 
 
 
358 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2457  hypothetical protein  30.47 
 
 
358 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2171  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.49 
 
 
343 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1137  hypothetical protein  28.67 
 
 
354 aa  99.4  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3029  hypothetical protein  30.08 
 
 
358 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000284319  normal  0.0136248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  33.2 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2406  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.09 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362363  normal  0.524454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  25.82 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1401  ribose ABC transporter, substrate binding protein  25.81 
 
 
315 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2806  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  27.65 
 
 
313 aa  87  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4780  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.43 
 
 
372 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462835  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  27.14 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1916  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  32.17 
 
 
386 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0176531  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.58 
 
 
309 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00405542  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2685  Monosaccharide-transporting ATPase  26.81 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.450778  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  27.91 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.62 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.1 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4186  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.2 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.32 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1857  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.68 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  hitchhiker  0.00271003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5599  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.92 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49086  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2371  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  30 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6712  ABC transporter  27.85 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.169373 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.9 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.15 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876756  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2035  Monosaccharide-transporting ATPase  25.53 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4098  sugar-binding transport protein  27.92 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3042  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.01 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6100  carbohydrate binding protein  28.03 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0287  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.6 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.128864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.83 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4028  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  27.92 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0127  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.92 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0343  D-ribose transporter subunit RbsB  26.06 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2837  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.11 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.165899  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0114  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  25.08 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.686148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1031  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.87 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50320  ABC transporter substrate binding protein  25.17 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1366  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.8 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450849  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4136  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.27 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3071  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.76 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.636476  normal  0.77485 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1336  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  24.7 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.454554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2435  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  23.27 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.919395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26220  Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator protein  27.35 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4898  D-ribose transporter subunit RbsB  24.73 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00612951  hitchhiker  0.000000869292 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.76 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2124  Monosaccharide-transporting ATPase  23.76 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.84 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0209  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  23.93 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1651  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.99 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2147  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.55 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0159332  normal  0.228113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50130  Periplasmic substrate-binding protein of sugar ABC transporter  25.5 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.2 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0636  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.34 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000233808  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0964  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.24 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2804  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  25.85 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331827  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2183  D-ribose-binding protein  24.29 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1653  ABC transporter sugar-binding protein  23.21 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.6 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0284  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  23.21 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0195  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  23.21 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2340  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.310763 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2242  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.31 
 
 
321 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.853779  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0344  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.38 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3164  Monosaccharide-transporting ATPase  24.6 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5745  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.96 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04060  hypothetical protein  26.96 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>