69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2556 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2457  hypothetical protein  99.44 
 
 		 358 aa  714    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3029  hypothetical protein  99.72 
 
 		 358 aa  717    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000284319  normal  0.0136248 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2556  putative sugar ABC transporter  100 
 
 		 358 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3048  hypothetical protein  85.59 
 
 		 358 aa  591  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1283  hypothetical protein  85.29 
 
 		 358 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.81326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2370  hypothetical protein  77.37 
 
 		 357 aa  571  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1193  hypothetical protein  84.05 
 
 		 357 aa  567  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1137  hypothetical protein  80.62 
 
 		 354 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2876  hypothetical protein  83.49 
 
 		 358 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1740  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.19 
 
 		 372 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0845  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.56 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0665  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.68 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0909  methylthioribose-binding protein  38.92 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0661  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  38.92 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0636  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.86 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000233808  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4828  putative sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  32.11 
 
 		 347 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0277486  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6148  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  28.81 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0762309  hitchhiker  0.00309202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2340  ABC transporter binding protein  30.82 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0518238  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6563  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.27 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5886  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.06 
 
 		 346 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.651755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2579  ABC transporter substrate-binding protein  27.48 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0517  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  33.69 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0404  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  28.98 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2580  ABC transporter substrate-binding protein  29 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840198 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5162  ABC transporter binding protein  29.02 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6576  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.6 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1256  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.6 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.307544  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6181  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.71 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5159  ABC transporter binding protein  28.25 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.535798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2877  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.17 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475569  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2996  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  34.17 
 
 		 334 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43630  periplasmic sugar binding protein  30.83 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0314584  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5972  rbsB; ABC transporter substrate binding protein (ribose)  32 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2996  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.99 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.809705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1513  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.47 
 
 		 521 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6459  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.64 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0427942  normal  0.0971645 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1166  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  30.47 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1426  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.47 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134002  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0414  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  30.47 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0135  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  30.47 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2757  sugar-binding protein, putative  30.17 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2995  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.34 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.700398  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43620  ribose ABC transporter  29.96 
 
 		 335 aa  89.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0182793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2758  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  28.93 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5165  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  31.44 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.08 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2365  ABC sugar (ribose) transporter, periplasmic substrate-binding subunit  31.08 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2724  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.23 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2406  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.57 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362363  normal  0.524454 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0023  ABC transporter ATP-binding protein  29.17 
 
 		 875 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4173  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.5 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3640  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.59 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3042  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.75 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1916  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.99 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0176531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2183  D-ribose-binding protein  25 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.98 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3320  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.21 
 
 		 311 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4318  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.53 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4186  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.13 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2298  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.09 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211923  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.84 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00405542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0266  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein ABC transporter  23.68 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1857  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.6 
 
 		 322 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  hitchhiker  0.00271003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3526  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.18 
 
 		 311 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3269  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.67 
 
 		 330 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3673  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.9 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.475948  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0113  putative ABC-type sugar transport system  24.53 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2825  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.48 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0048  putative D-ribose-binding periplasmic protein  22.35 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  0.240357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>