108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1137 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1137  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3048  hypothetical protein  87.05 
 
 
358 aa  595  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1283  hypothetical protein  87.35 
 
 
358 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.81326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2370  hypothetical protein  81.3 
 
 
357 aa  590  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3029  hypothetical protein  82.02 
 
 
358 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000284319  normal  0.0136248 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2556  putative sugar ABC transporter  81.74 
 
 
358 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2457  hypothetical protein  81.74 
 
 
358 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1193  hypothetical protein  84.05 
 
 
357 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2876  hypothetical protein  84.78 
 
 
358 aa  567  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1740  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.96 
 
 
372 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0845  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.64 
 
 
381 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0909  methylthioribose-binding protein  40 
 
 
370 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0661  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  39.5 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0665  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.19 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0636  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 
354 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000233808  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4828  putative sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  31.99 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0277486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2579  ABC transporter substrate-binding protein  30.61 
 
 
344 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6563  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.3 
 
 
348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6148  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  29.79 
 
 
348 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0762309  hitchhiker  0.00309202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0517  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  34.08 
 
 
346 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2340  ABC transporter binding protein  31.16 
 
 
351 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0518238  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5886  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.32 
 
 
346 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.651755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2580  ABC transporter substrate-binding protein  30.7 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0840198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0404  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  30.28 
 
 
368 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5162  ABC transporter binding protein  30.89 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5159  ABC transporter binding protein  34.08 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.535798  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6181  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.71 
 
 
356 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1256  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.7 
 
 
356 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.307544  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6576  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.7 
 
 
356 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807047  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2877  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.51 
 
 
334 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475569  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2996  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  32.92 
 
 
334 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5972  rbsB; ABC transporter substrate binding protein (ribose)  33.07 
 
 
337 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6459  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.07 
 
 
337 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0427942  normal  0.0971645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2995  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.38 
 
 
342 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.700398  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43630  periplasmic sugar binding protein  31.28 
 
 
328 aa  99.4  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0314584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2758  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  31.97 
 
 
342 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43620  ribose ABC transporter  29.88 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0182793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2996  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.86 
 
 
323 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.809705  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0135  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  28.67 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366053  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0414  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein, putative  28.67 
 
 
336 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1513  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.67 
 
 
521 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1426  putative carbohydrate ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.03 
 
 
336 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134002  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1166  ABC periplasmic-binding sugar transport protein  28.67 
 
 
336 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2757  sugar-binding protein, putative  30.45 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5165  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  31.5 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2365  ABC sugar (ribose) transporter, periplasmic substrate-binding subunit  29.18 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.18 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2724  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.29 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1916  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.83 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0176531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2406  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.67 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362363  normal  0.524454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0612  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.14 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3640  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.88 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4318  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.59 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1857  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.15 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  hitchhiker  0.00271003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0987  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.14 
 
 
392 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3042  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.8 
 
 
315 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0023  ABC transporter ATP-binding protein  26.7 
 
 
875 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  25.51 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0266  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein ABC transporter  27.19 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4780  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.37 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462835  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4173  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.2 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2124  Monosaccharide-transporting ATPase  27.5 
 
 
316 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2801  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.96 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.73 
 
 
321 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3673  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.63 
 
 
320 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.475948  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3526  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 
311 aa  52.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  26.15 
 
 
295 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4186  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.74 
 
 
325 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0964  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.07 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0363  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.47 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879984  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4654  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.49 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.995284  normal  0.589042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3428  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.71 
 
 
377 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00746761  hitchhiker  0.000105285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3320  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.25 
 
 
311 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4759  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.83 
 
 
313 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125335  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3770  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.71 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.741987  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5319  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.34 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0693893  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1193  putative ABC transporter  26.9 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.14 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00405542  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2242  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.19 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.853779  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4540  ABC transporter substrate-binding protein  30.46 
 
 
344 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2340  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.57 
 
 
306 aa  46.6  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.310763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2603  twin-arginine translocation pathway signal  21.71 
 
 
338 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.912871  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0577  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.11 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.130999  normal  0.503483 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  26.36 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2183  D-ribose-binding protein  25.63 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  23.47 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4058  monosaccharide-binding protein  26.51 
 
 
399 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4864  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.92 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6851  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.58 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3064  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.82 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0344  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.81 
 
 
306 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0209  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  26.18 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6712  ABC transporter  24.68 
 
 
315 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.169373 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4011  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.14 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0048  putative D-ribose-binding periplasmic protein  22.52 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1668  ABC transporter sugar-binding protein  24.56 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6100  carbohydrate binding protein  22.75 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6094  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.68 
 
 
323 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2806  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  27.19 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3058  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.55 
 
 
370 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>