78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0299 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  100 
 
 		 355 aa  723    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  50.43 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  53.89 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  46.27 
 
 		 339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  43.48 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  41.21 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  40.52 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  39.55 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  38.6 
 
 		 341 aa  222  6e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  41.38 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  34.64 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.2 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.47 
 
 		 355 aa  209  8e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  34.51 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  35.56 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.26 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  34.93 
 
 		 379 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.9 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  29.41 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  30.38 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.57 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  30.1 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  29.44 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  28.41 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  30.69 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  27.35 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  33.94 
 
 		 296 aa  96.3  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2130  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.48 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.645548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.88 
 
 		 385 aa  92.4  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0669  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.55 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.66 
 
 		 276 aa  86.7  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.575863 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1645  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.23 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0813074 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2078  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.88 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.810924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0606  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.15 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  27.72 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  26.74 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  31.06 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0980  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.14 
 
 		 599 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  27.54 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2223  sugar isomerase (SIS)  19.69 
 
 		 584 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.22495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  27.54 
 
 		 197 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.91 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  34.91 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  27.33 
 
 		 198 aa  46.2  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  39.02 
 
 		 285 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1884  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.3 
 
 		 623 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252236  normal  0.154309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01570  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.13 
 
 		 608 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  39.02 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  39.02 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0295  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.88 
 
 		 609 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.250697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0667  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  27.06 
 
 		 631 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.469007  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0838  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.4 
 
 		 603 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0609896  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  29.34 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  26.79 
 
 		 197 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1600  hypothetical protein  25.1 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  27.38 
 
 		 197 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  29.37 
 
 		 188 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2523  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.4 
 
 		 629 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  27.38 
 
 		 197 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  26.55 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  27.38 
 
 		 197 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  27.38 
 
 		 197 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  27.38 
 
 		 197 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  27.38 
 
 		 197 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  27.38 
 
 		 197 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  27.38 
 
 		 197 aa  43.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  34.52 
 
 		 193 aa  42.7  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  26.77 
 
 		 438 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29300  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  26.8 
 
 		 621 aa  42.7  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  26.79 
 
 		 197 aa  42.7  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2605  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  28.36 
 
 		 618 aa  42.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  27.38 
 
 		 197 aa  42.7  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>