84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1238 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  100 
 
 		 347 aa  701    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  43.84 
 
 		 354 aa  299  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  44.38 
 
 		 340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  43.48 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  36.44 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  41.03 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.84 
 
 		 360 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  34.83 
 
 		 357 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  32.04 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  36.99 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  36.95 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.56 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.21 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.63 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  28.45 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  33.25 
 
 		 379 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  37.42 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.24 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  30.18 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  29.92 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.91 
 
 		 296 aa  96.3  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2130  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.95 
 
 		 300 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.645548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  30.71 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  28.38 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0669  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.8 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  28.95 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0606  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1645  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0813074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  27.7 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.04 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.575863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3838  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.86 
 
 		 611 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2000  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.98 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.53 
 
 		 385 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.45 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2078  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.15 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.810924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0131  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.03 
 
 		 612 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.533815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01415  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.22 
 
 		 615 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4464  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.28 
 
 		 612 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2658  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.28 
 
 		 612 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.144051 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0080  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.33 
 
 		 614 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0166256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1433  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.73 
 
 		 611 aa  54.3  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000916025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2605  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.88 
 
 		 634 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.02871  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0083  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.32 
 
 		 615 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2605  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  28.94 
 
 		 618 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0102  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.6 
 
 		 615 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.52 
 
 		 613 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  24.61 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3096  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.35 
 
 		 615 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.617248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29300  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  26.35 
 
 		 621 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2676  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.76 
 
 		 622 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0667  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  27.48 
 
 		 631 aa  49.7  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.469007  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1065  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.34 
 
 		 635 aa  49.7  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0809792 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0933  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.24 
 
 		 612 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.474565  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  27.44 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.81 
 
 		 621 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.386153 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1156  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.81 
 
 		 621 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1139  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.81 
 
 		 621 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0208  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.75 
 
 		 609 aa  47.8  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0172875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23190  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.75 
 
 		 622 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0529184  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2223  sugar isomerase (SIS)  24.63 
 
 		 584 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.22495  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1372  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.74 
 
 		 613 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.742215  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0089  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.26 
 
 		 614 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0724  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.35 
 
 		 622 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0532608  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0623  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.55 
 
 		 621 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.485363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2210  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.45 
 
 		 609 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  31.89 
 
 		 539 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1487  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.83 
 
 		 609 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  22.54 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  21.3 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0104  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.84 
 
 		 609 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.91 
 
 		 614 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1342  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.44 
 
 		 620 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0950  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.9 
 
 		 608 aa  43.5  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.14 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16770  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.45 
 
 		 600 aa  43.9  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2099  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  29.6 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0418569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4351  sugar isomerase (SIS)  28.32 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2933  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.91 
 
 		 609 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.850684  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26700  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  23.65 
 
 		 611 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.295004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6558  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.35 
 
 		 620 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>