40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1766 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
341 aa  673    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  38.6 
 
 
355 aa  222  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  39.22 
 
 
340 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  36.95 
 
 
347 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  33.43 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.67 
 
 
354 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  33.54 
 
 
339 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.65 
 
 
319 aa  153  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.74 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  33.97 
 
 
368 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  27.74 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.94 
 
 
360 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  33.13 
 
 
379 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  34.51 
 
 
349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  28.94 
 
 
355 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.03 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.41 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.84 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.37 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  29.55 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  28.74 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.87 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.575863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  29.57 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2130  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.19 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.645548  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  27.69 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.05521 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.39 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2078  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.82 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.810924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  30.21 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0669  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.66 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0606  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.22 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  30.43 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1645  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.93 
 
 
305 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0813074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  29.82 
 
 
382 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  24.55 
 
 
377 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  29.39 
 
 
386 aa  49.7  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16770  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.79 
 
 
600 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1425  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  55.77 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789085  normal  0.0513536 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0933  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.23 
 
 
612 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.474565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0623  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
621 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.485363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>