58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1271 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  100 
 
 
356 aa  728    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  41.43 
 
 
354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  41.21 
 
 
355 aa  266  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  37.5 
 
 
340 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  35.82 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.38 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  36.44 
 
 
347 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.43 
 
 
360 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  33.43 
 
 
368 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  33.43 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.66 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.63 
 
 
355 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  29.34 
 
 
355 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  36.51 
 
 
346 aa  168  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  29.52 
 
 
328 aa  169  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  32.98 
 
 
379 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.54 
 
 
319 aa  157  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.09 
 
 
349 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  24.93 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  25.33 
 
 
398 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.19 
 
 
327 aa  123  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  26.08 
 
 
387 aa  109  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  38.18 
 
 
296 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  25.4 
 
 
399 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  24 
 
 
377 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  24.24 
 
 
369 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.81 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.575863 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  25.2 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  21.39 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  22.46 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2078  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.86 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.810924  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0669  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.35 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2130  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.41 
 
 
300 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.645548  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  24.02 
 
 
390 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0606  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.11 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1645  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.34 
 
 
305 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0813074 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  27.71 
 
 
438 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  26.26 
 
 
437 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  26.26 
 
 
437 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  28.48 
 
 
450 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0838  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.01 
 
 
603 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0609896  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  27.31 
 
 
405 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  24.26 
 
 
439 aa  47.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  28.67 
 
 
402 aa  46.6  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  27.74 
 
 
453 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  28.72 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  26.54 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0980  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.64 
 
 
599 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  19.7 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  23.53 
 
 
445 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0950  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 
608 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  25.5 
 
 
450 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2605  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  32.1 
 
 
618 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3096  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.1 
 
 
615 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.617248  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  24.46 
 
 
434 aa  43.1  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0667  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.86 
 
 
631 aa  42.7  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.469007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16770  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.92 
 
 
600 aa  42.7  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>