47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5856 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 390 aa  741    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  61.8 
 
 		 382 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  48.44 
 
 		 379 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  48.42 
 
 		 398 aa  272  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  48.21 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  46.11 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  46.88 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  43.26 
 
 		 387 aa  232  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  42.71 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  40.67 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  38.17 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 381 aa  182  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  27.96 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.03 
 
 		 355 aa  132  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.04 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  35.01 
 
 		 358 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  22.37 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  34.89 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.73 
 
 		 357 aa  93.6  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.27 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.86 
 
 		 347 aa  90.1  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  30.47 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.66 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  21.77 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.39 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  22.93 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  35.83 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.27 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  21.3 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  27.46 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  21.01 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.13 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  31.92 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  31.2 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  22.38 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  32.45 
 
 		 324 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2658  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.58 
 
 		 612 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.144051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4464  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.58 
 
 		 612 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  34.59 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  37.62 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  37.62 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  34.55 
 
 		 185 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  41 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  36.63 
 
 		 324 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0131  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.54 
 
 		 612 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.533815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>