39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3839 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 385 aa  718    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  46.11 
 
 		 387 aa  288  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  45.34 
 
 		 386 aa  279  7e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  44.27 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  42.93 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  42.08 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  44.68 
 
 		 399 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  38.16 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  39.58 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  37.89 
 
 		 382 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  39.04 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  40 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.88 
 
 		 355 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  38.14 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  32.35 
 
 		 342 aa  92.8  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  31.66 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  22.22 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  27.69 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.43 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.04 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  32.98 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  22.46 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  23.85 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.75 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  23.44 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  33.11 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  22.46 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.85 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  33 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.53 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.51 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1365  hypothetical protein  30.21 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  30.08 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  30.08 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.75 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  32.37 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0771  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  32.5 
 
 		 349 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00429754  hitchhiker  0.00140169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>