28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4296 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 381 aa  721    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  38.8 
 
 		 379 aa  193  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  37.5 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  34.9 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  37.97 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  37.6 
 
 		 398 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  38.32 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  37.1 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  36.46 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  37.73 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  37.14 
 
 		 386 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  36.51 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  35.62 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  35.71 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  35.91 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  33.73 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  35.47 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  37.08 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  32.52 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  24.11 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1365  hypothetical protein  33.94 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  20.23 
 
 		 356 aa  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.07 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  22.8 
 
 		 340 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  19.4 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  32.7 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  32.7 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>