26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1427 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  653    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  33.88 
 
 		 387 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  35.47 
 
 		 377 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  34.32 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  32.11 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  30.54 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  32.61 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  31.84 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  33.6 
 
 		 385 aa  92.4  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  30.42 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  31.78 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  32.18 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  36.94 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  30.72 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  30.47 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.74 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  30 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  31.75 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  35.37 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  33.77 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  26.26 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.61 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.82 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  24.41 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>