68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0509 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  100 
 
 		 355 aa  738    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  90.14 
 
 		 355 aa  677    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  90.99 
 
 		 355 aa  680    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  36.57 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.2 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  34.12 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  33.81 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  31.85 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.79 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.21 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.66 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.65 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  29.48 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.21 
 
 		 319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  28.81 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  30.95 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  30.03 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.71 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  26.3 
 
 		 387 aa  89.4  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.54 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  25.79 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  24.86 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  26.32 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  24.92 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.4 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.69 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.575863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  23.46 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  26.04 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.47 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2130  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.645548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0606  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.19 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0669  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.74 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2078  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.9 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.810924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4149  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.96 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01415  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.29 
 
 		 615 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411178  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1645  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0813074 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2730  RpiR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2807  RpiR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1477  RpiR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0724  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.41 
 
 		 622 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0532608  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  24.38 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0365  RpiR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2611  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.11 
 
 		 622 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2223  sugar isomerase (SIS)  24.24 
 
 		 584 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.22495  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2767  RpiR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 312 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2912  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.68 
 
 		 630 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.379512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3485  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.74 
 
 		 633 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.739324  normal  0.133016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2129  RpiR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 312 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2741  RpiR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 312 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16770  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.79 
 
 		 600 aa  46.2  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5218  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase  24.8 
 
 		 625 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0983  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.69 
 
 		 629 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  hitchhiker  0.00629228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23190  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24 
 
 		 622 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0529184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6069  RpiR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29300  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  22.09 
 
 		 621 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.81 
 
 		 616 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2634  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.91 
 
 		 636 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.834357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  25.4 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0667  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.71 
 
 		 631 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.469007  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2605  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.89 
 
 		 618 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4463  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.95 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2621  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.14 
 
 		 630 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.204454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0550  RpiR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.79 
 
 		 622 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.430985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0083  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.32 
 
 		 615 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0809  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.57 
 
 		 601 aa  42.7  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00887379  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3096  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.27 
 
 		 615 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.617248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>