40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0758 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  724    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  54.77 
 
 
368 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  52.96 
 
 
379 aa  347  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  45.33 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  45.19 
 
 
398 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  41.71 
 
 
387 aa  246  6e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  43.04 
 
 
399 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  43.45 
 
 
369 aa  229  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  43.01 
 
 
382 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  39.58 
 
 
385 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  35.98 
 
 
386 aa  190  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
381 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  35.2 
 
 
342 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.35 
 
 
355 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.86 
 
 
354 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  26.06 
 
 
339 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  33.14 
 
 
362 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.71 
 
 
347 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.86 
 
 
340 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.27 
 
 
356 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  25.34 
 
 
355 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.86 
 
 
319 aa  89  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.34 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  33.7 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.24 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.31 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  31.66 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  29.64 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.22 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.01 
 
 
360 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1365  hypothetical protein  32.23 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  19.33 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  25.24 
 
 
341 aa  53.5  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  33.48 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  31.63 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  31.63 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  33.6 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.81 
 
 
349 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.76 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.68214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>