38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0753 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  724    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  64.19 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  53.16 
 
 		 379 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  45.21 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  47.57 
 
 		 398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  47.93 
 
 		 398 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  45.12 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  44.94 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  44.76 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  40.53 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  38.92 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  40.26 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 381 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.04 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.72 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.4 
 
 		 354 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  27.75 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.16 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.8 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  37.45 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.04 
 
 		 347 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  31.28 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.56 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  24.16 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.94 
 
 		 360 aa  89.7  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  31.01 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  33.59 
 
 		 358 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.62 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  22.22 
 
 		 319 aa  79.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  43.44 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.43 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  22.19 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.49 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  37.12 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  31.15 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.53 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  32.11 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.22 
 
 		 276 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.575863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>