55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0900 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  763    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  96.23 
 
 		 398 aa  699    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  72.84 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  51.97 
 
 		 379 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  47.47 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  46.51 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  45.19 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  42.93 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  45.6 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  41.55 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 390 aa  235  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  39.9 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.33 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.18 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.1 
 
 		 355 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.33 
 
 		 340 aa  126  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  26.85 
 
 		 339 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.49 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.32 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  41.92 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  36.77 
 
 		 358 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  31.84 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.38 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  22.89 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.32 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  29.22 
 
 		 341 aa  90.1  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  21.78 
 
 		 328 aa  90.1  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  24.2 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.93 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  33.46 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.76 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.76 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  31.67 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.06 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 323 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  35.95 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  35.47 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.95 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  33.6 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1365  hypothetical protein  33.72 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  35.16 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  38.05 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  36.26 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.31 
 
 		 276 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.575863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  38.61 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  36.26 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  38.54 
 
 		 328 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  32.67 
 
 		 324 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  25.44 
 
 		 323 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004409  N-acetylmuramic acid 6-phosphate etherase  33.6 
 
 		 309 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  29.84 
 
 		 325 aa  43.5  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0172  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  39.29 
 
 		 302 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  42.27 
 
 		 363 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  42.27 
 
 		 363 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>