23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13285 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  646    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  57.34 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1365  hypothetical protein  64.25 
 
 		 363 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  64.25 
 
 		 363 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  64.25 
 
 		 363 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  57.34 
 
 		 371 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  43.41 
 
 		 366 aa  176  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  41.02 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  45.91 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  38.4 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  34.6 
 
 		 385 aa  87  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  37.5 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  35.95 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  34.82 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  33.8 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  34.04 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  31.2 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  38.89 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  31.58 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  29.47 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  30.95 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  34.08 
 
 		 399 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>