23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1365 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  98.35 
 
 
363 aa  669    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  98.35 
 
 
363 aa  669    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1365  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  678    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  67.57 
 
 
369 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  67.49 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  64.8 
 
 
346 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  43.56 
 
 
366 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  39.73 
 
 
378 aa  159  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  45.25 
 
 
362 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  35.88 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  31.93 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  31.1 
 
 
385 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  33.45 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  32.88 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  36.84 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  34.75 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  35.68 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  33.11 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  40.15 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  31.23 
 
 
386 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  29.77 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  33.81 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>