45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0467 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 387 aa  757    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  47.63 
 
 		 379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  46.11 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  44.18 
 
 		 368 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  47.06 
 
 		 398 aa  276  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  46.51 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  41.71 
 
 		 377 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  44.04 
 
 		 399 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  43.46 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  40.49 
 
 		 369 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  37.76 
 
 		 386 aa  206  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.41 
 
 		 355 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.47 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.57 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.18 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.08 
 
 		 356 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  27.65 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  34.58 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  32.35 
 
 		 358 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  28.74 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.44 
 
 		 319 aa  93.2  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  26.47 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.3 
 
 		 355 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.74 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.06 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.06 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  35.69 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.79 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.81 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  34.22 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  22.53 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2078  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.36 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.810924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  33.78 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  33.82 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.7 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.575863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.75 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  28.82 
 
 		 346 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2099  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  33.03 
 
 		 367 aa  46.6  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0418569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  30.82 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  21.88 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.8 
 
 		 622 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.430985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>