24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3298 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  717    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  44.76 
 
 		 366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  40.16 
 
 		 369 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  45.17 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  41.62 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1365  hypothetical protein  40.27 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  40.27 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  40.27 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  37.87 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  42.86 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  38.46 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  33.04 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  33.89 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  32.23 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  36.48 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  29.96 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  31.9 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  33.45 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  33.86 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  32.26 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  40.82 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  32.32 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  31.92 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>