23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1188 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  42.43 
 
 		 369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  43.46 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  44.69 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1365  hypothetical protein  42.78 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  43.41 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  42.78 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  42.78 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  38.59 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  42.52 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  34.97 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  33.77 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  30.91 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  32.72 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  36.54 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  33.74 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  30.71 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  33.48 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  28.15 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  42.42 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  35.32 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  36.46 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>