24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4725 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  711    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  76.36 
 
 
371 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1365  hypothetical protein  67.57 
 
 
363 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  67.85 
 
 
363 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  67.85 
 
 
363 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  57.89 
 
 
346 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  42.43 
 
 
366 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  40.7 
 
 
378 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  43.78 
 
 
362 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  36.29 
 
 
358 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  31.66 
 
 
385 aa  86.3  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  32.75 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  31.22 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  33.23 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  30.17 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  31.82 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  33.1 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  35.08 
 
 
369 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  31.21 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  30.33 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  35.04 
 
 
426 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  32.11 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  35.05 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.161411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>