35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08570 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  100 
 
 		 386 aa  745    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  45.34 
 
 		 385 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  37.76 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  37.37 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  39.79 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  37.31 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  38.97 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  39.9 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  35.98 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  39.06 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  34.64 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.2 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  35.06 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  30.16 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  27.67 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.72 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.71 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  33.77 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.09 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  30.26 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.19 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  31.8 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  34.33 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  23.78 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  29.39 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  30.56 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.61 
 
 		 347 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  20.81 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.29 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.31 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  35.42 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  19.73 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.14 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>