48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22730 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  100 
 
 
357 aa  720    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  46.31 
 
 
360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  40.23 
 
 
354 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  39.55 
 
 
355 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  38.91 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.67 
 
 
356 aa  233  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  34.83 
 
 
347 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  32.55 
 
 
339 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  30.9 
 
 
355 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.79 
 
 
355 aa  192  6e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.62 
 
 
355 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  30.63 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  30.83 
 
 
379 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  36.07 
 
 
349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.12 
 
 
319 aa  162  6e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  30.91 
 
 
368 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  30.74 
 
 
341 aa  160  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.96 
 
 
346 aa  122  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  26.8 
 
 
398 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  26.49 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  24.06 
 
 
387 aa  99.8  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.01 
 
 
327 aa  96.7  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  24.61 
 
 
399 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  24.66 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  26.07 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  22.83 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  23.31 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.85 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.82 
 
 
276 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.575863 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0669  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.94 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2078  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.19 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.810924  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  19.84 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2130  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.31 
 
 
300 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.645548  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1645  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.71 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0813074 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0606  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.02 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2223  sugar isomerase (SIS)  24.12 
 
 
584 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.22495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0295  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.96 
 
 
609 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.250697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  25.39 
 
 
358 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0471  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  28.05 
 
 
602 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  19.4 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  26.86 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  28.24 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  25.68 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  22.94 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  26.85 
 
 
437 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06356  glucokinase  30.7 
 
 
287 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>