41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1645 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1645  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  100 
 
 
305 aa  613  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0813074 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0669  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  81 
 
 
300 aa  496  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2130  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  77.93 
 
 
300 aa  496  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.645548  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0606  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  77.26 
 
 
299 aa  464  1e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.74 
 
 
327 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.76 
 
 
319 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.97 
 
 
355 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.25 
 
 
347 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.1 
 
 
346 aa  90.1  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  29.04 
 
 
328 aa  87  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.11 
 
 
354 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.36 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.01 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.575863 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  30.2 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.39 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  25.3 
 
 
355 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.22 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.95 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.3 
 
 
355 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  33.99 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  29.56 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  22 
 
 
323 aa  56.6  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  23.69 
 
 
357 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  27.6 
 
 
368 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2078  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.810924  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  27.95 
 
 
379 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  35.11 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  34.91 
 
 
331 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.03 
 
 
360 aa  45.8  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  25.27 
 
 
384 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  26.62 
 
 
384 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  30.09 
 
 
354 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  33.03 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  30.97 
 
 
333 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  30.97 
 
 
359 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  33.64 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
285 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
285 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  34.44 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>