30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0098 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  100 
 
 
296 aa  590  1e-167  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  40.48 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.575863 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2078  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  38.75 
 
 
313 aa  186  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.810924  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  36.36 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.29 
 
 
356 aa  116  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.91 
 
 
340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.03 
 
 
354 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.91 
 
 
347 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  31.13 
 
 
328 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  33.02 
 
 
346 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30 
 
 
327 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.23 
 
 
355 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  30.49 
 
 
368 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  32.54 
 
 
339 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  30.04 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.62 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2130  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.42 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.645548  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.36 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.27 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  28.5 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.18 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  24.82 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  24.21 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0606  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  33.77 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0669  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.45 
 
 
300 aa  60.1  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  23.61 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1645  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  34.21 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0813074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  24.44 
 
 
387 aa  55.8  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  21.1 
 
 
398 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0343044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>