222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1707 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
384 aa  788    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  41.36 
 
 
387 aa  279  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  38.4 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  37.89 
 
 
390 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  39.52 
 
 
388 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  39.13 
 
 
377 aa  257  3e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  36.58 
 
 
395 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  40.16 
 
 
384 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  40.05 
 
 
384 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  40.05 
 
 
384 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  39.63 
 
 
386 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  40.48 
 
 
384 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  40.48 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  40.75 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  36.32 
 
 
395 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  39.84 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  39.84 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  39.84 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  39.89 
 
 
386 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  39.84 
 
 
386 aa  242  9e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  36.94 
 
 
388 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  37.6 
 
 
380 aa  238  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  37.33 
 
 
397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  34.67 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  36.98 
 
 
384 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  37.23 
 
 
388 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  37.23 
 
 
388 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  36.41 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  37.13 
 
 
388 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  35.53 
 
 
400 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  31.91 
 
 
384 aa  208  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  33.76 
 
 
388 aa  206  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  28.16 
 
 
354 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  29.17 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.71 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.71 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  25.48 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.58 
 
 
586 aa  67  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1553  sugar isomerase (SIS)  23.75 
 
 
309 aa  63.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0832  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  26.02 
 
 
353 aa  63.2  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.2 
 
 
602 aa  60.1  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0782  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  26.4 
 
 
344 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2453  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  25.2 
 
 
606 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.633572  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2361  sugar isomerase (SIS)  25.52 
 
 
295 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.176802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4716  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.74 
 
 
605 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1372  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.48 
 
 
613 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.742215  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  24.84 
 
 
317 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.53 
 
 
610 aa  56.6  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.85 
 
 
607 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2658  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.02 
 
 
612 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.144051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1709  sugar isomerase (SIS)  25.34 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.45 
 
 
608 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316108  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4464  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.75 
 
 
612 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582003  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  24.7 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0295  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.81 
 
 
609 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.250697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.57 
 
 
608 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3375  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.59 
 
 
608 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4261  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.72 
 
 
610 aa  53.1  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0562  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.61 
 
 
338 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.149002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5182  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.54 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.91 
 
 
610 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16620  predicted phosphosugar isomerase  24.5 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.816556  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  25.59 
 
 
610 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3423  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.26 
 
 
607 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4154  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase(isomerizing)  29.71 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.03 
 
 
612 aa  51.6  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.53 
 
 
608 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4564  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.72 
 
 
610 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4198  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.32 
 
 
611 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4266  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.26 
 
 
607 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4100  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.26 
 
 
607 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1425  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  29.71 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789085  normal  0.0513536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.14 
 
 
616 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.51 
 
 
616 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2636  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.98 
 
 
610 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0083  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.85 
 
 
615 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3539  sugar isomerase (SIS)  24.23 
 
 
310 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632744  normal  0.722718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.63 
 
 
613 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0462  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.6 
 
 
611 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661359  normal  0.367239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3186  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.64 
 
 
602 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.24 
 
 
611 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0997  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  24.1 
 
 
620 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0138592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0131  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.28 
 
 
612 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.533815  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2686  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.9 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3994  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.86 
 
 
607 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13069  normal  0.149287 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2322  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.67 
 
 
610 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.83 
 
 
616 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4463  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.01 
 
 
609 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1433  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.25 
 
 
611 aa  50.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000916025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0950  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.75 
 
 
608 aa  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4598  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.07 
 
 
606 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1487  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.06 
 
 
609 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3511  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.32 
 
 
607 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.298041  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2000  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.81 
 
 
611 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.22 
 
 
604 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00787508  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0582  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.19 
 
 
607 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0623132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0312  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.95 
 
 
579 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1991  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.82 
 
 
610 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1739  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.42 
 
 
628 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15236  normal  0.181202 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0547  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.19 
 
 
607 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>