99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2392 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  100 
 
 
384 aa  796    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  72.66 
 
 
384 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  72.66 
 
 
384 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  72.66 
 
 
384 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  74.39 
 
 
380 aa  581  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  72.4 
 
 
384 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  73.99 
 
 
384 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  73.99 
 
 
384 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  72.4 
 
 
384 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  71.88 
 
 
384 aa  578  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  48.09 
 
 
387 aa  332  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  43.56 
 
 
388 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  43.85 
 
 
388 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  43.85 
 
 
388 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  44.97 
 
 
388 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  45.16 
 
 
386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  44.74 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  45.16 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  41.3 
 
 
395 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  41.3 
 
 
395 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  42.63 
 
 
388 aa  298  9e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  42.25 
 
 
397 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  39.95 
 
 
390 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  42.78 
 
 
388 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  39.27 
 
 
390 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  40.83 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  42.36 
 
 
377 aa  281  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  40.27 
 
 
376 aa  279  7e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  41.12 
 
 
384 aa  272  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  43.73 
 
 
388 aa  263  4.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  40.16 
 
 
384 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  33.07 
 
 
400 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.07 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.7 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.65 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  28.67 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  27.27 
 
 
317 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  25.54 
 
 
329 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  23.23 
 
 
302 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0203  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.68 
 
 
606 aa  54.3  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1553  sugar isomerase (SIS)  22.15 
 
 
309 aa  53.1  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2621  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.79 
 
 
630 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.204454 
 
 
-
 
NC_002978  WD0535  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  22.99 
 
 
606 aa  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.241436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.14 
 
 
611 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25 
 
 
611 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25 
 
 
611 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.58 
 
 
609 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.58 
 
 
609 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.22 
 
 
609 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.58 
 
 
609 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  22.76 
 
 
610 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4564  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.81 
 
 
610 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0531  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.27 
 
 
593 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.840167  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.87 
 
 
609 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2912  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.17 
 
 
630 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.379512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4261  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.62 
 
 
610 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2658  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  21.65 
 
 
612 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.144051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4142  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.13 
 
 
609 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4198  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.87 
 
 
611 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.13 
 
 
610 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4250  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.71 
 
 
609 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.87 
 
 
609 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4464  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  21.65 
 
 
612 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582003  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.46 
 
 
611 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  21.87 
 
 
609 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  21.87 
 
 
609 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.83 
 
 
611 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  21.87 
 
 
609 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.87 
 
 
609 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5165  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.87 
 
 
609 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.87 
 
 
609 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.87 
 
 
609 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.87 
 
 
609 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.37 
 
 
609 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4086  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.13 
 
 
609 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.16 
 
 
586 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.3 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2231  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  20.85 
 
 
579 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1739  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.22 
 
 
628 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15236  normal  0.181202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.25 
 
 
609 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.39 
 
 
609 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3838  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.94 
 
 
611 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.9 
 
 
608 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0607297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.8 
 
 
609 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.53 
 
 
613 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.35 
 
 
609 aa  43.5  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.58 
 
 
609 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0428  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.97 
 
 
603 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.22 
 
 
609 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.22 
 
 
609 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.68 
 
 
609 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2171  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.19 
 
 
608 aa  43.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.39 
 
 
612 aa  43.1  0.009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.08 
 
 
609 aa  42.7  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.22 
 
 
609 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16770  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.83 
 
 
600 aa  42.7  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401554  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.68 
 
 
609 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.68 
 
 
609 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  19.57 
 
 
610 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>