77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2961 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  97.95 
 
 		 390 aa  786    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  100 
 
 		 390 aa  798    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  45.52 
 
 		 388 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  44.62 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  43.15 
 
 		 387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  41.91 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  41.64 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  39.79 
 
 		 380 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  39.74 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  37.69 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  39.89 
 
 		 397 aa  289  7e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  38.96 
 
 		 386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  39.64 
 
 		 386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  39.27 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  39.85 
 
 		 388 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  39.85 
 
 		 388 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  40.1 
 
 		 388 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  39.15 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  39.15 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  39.15 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  38.62 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  40.81 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  38.62 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  38.89 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  38.62 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  38.62 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  40.98 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  37.89 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  43.2 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  36.87 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  39.3 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  34.18 
 
 		 400 aa  230  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  26.36 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  26.58 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  26.58 
 
 		 330 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16620  predicted phosphosugar isomerase  24.86 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.816556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.25 
 
 		 602 aa  63.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  26.59 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.93 
 
 		 586 aa  59.7  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  24.89 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2367  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  19.89 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.192922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0557  glutamine amidotransferase class-II  24.93 
 
 		 595 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0217715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2231  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.83 
 
 		 579 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2361  sugar isomerase (SIS)  25.65 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.176802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01970  predicted phosphosugar isomerase  24.16 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.212959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3539  sugar isomerase (SIS)  21.47 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632744  normal  0.722718 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.94 
 
 		 613 aa  50.4  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.851914  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.8 
 
 		 591 aa  50.4  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  26.38 
 
 		 329 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.69 
 
 		 608 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.67 
 
 		 613 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2686  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  22.87 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2933  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.66 
 
 		 609 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.850684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4154  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase(isomerizing)  28.11 
 
 		 335 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0312  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.37 
 
 		 579 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0562  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  30.27 
 
 		 338 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.149002 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  26.22 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2161  sugar isomerase (SIS)  25 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3111  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  21.98 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0685  sugar isomerase  20.83 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1778  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.61 
 
 		 602 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.285931  normal  0.0291099 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.05 
 
 		 610 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2606  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.96 
 
 		 608 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659057  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  23.36 
 
 		 610 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.02 
 
 		 610 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1005  sugar isomerase (SIS)  22.82 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1425  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  22.91 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789085  normal  0.0513536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1372  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.69 
 
 		 613 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.742215  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0619  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.07 
 
 		 605 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247891  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0626  sugar isomerase  20.83 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3186  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.25 
 
 		 602 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0294  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  29.73 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0782  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  21.85 
 
 		 344 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1433  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.08 
 
 		 611 aa  43.9  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000916025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.12 
 
 		 607 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1709  sugar isomerase (SIS)  24.62 
 
 		 305 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.94 
 
 		 604 aa  42.7  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00787508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>