55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0115 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  100 
 
 		 388 aa  792    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  57.99 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  56.41 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  50.26 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  44.02 
 
 		 395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  44.02 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  44.62 
 
 		 390 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  44.47 
 
 		 390 aa  322  6e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  42.63 
 
 		 384 aa  298  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  42.78 
 
 		 380 aa  297  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  40.72 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  42.56 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  41.32 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  42.56 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  39.48 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  39.9 
 
 		 386 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  41.05 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  41.05 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  41.05 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  41.05 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  41.05 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  41.05 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  39.64 
 
 		 386 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  39.85 
 
 		 388 aa  281  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  42.31 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  40.79 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  40.37 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  41.65 
 
 		 384 aa  270  5e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  37.33 
 
 		 397 aa  264  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  38.89 
 
 		 384 aa  250  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  34.67 
 
 		 384 aa  232  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  30.67 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  23.66 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  26.22 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  24.23 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.91 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.28 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1553  sugar isomerase (SIS)  25.53 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  23.33 
 
 		 317 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.21 
 
 		 608 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0777  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.1 
 
 		 606 aa  50.4  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000026316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0800  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.1 
 
 		 606 aa  50.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00580446  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  24.27 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.6 
 
 		 610 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.25 
 
 		 611 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2934  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.11 
 
 		 608 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.729718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2606  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.2 
 
 		 608 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659057  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01970  predicted phosphosugar isomerase  25.09 
 
 		 291 aa  46.2  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.212959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.25 
 
 		 611 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.92 
 
 		 611 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0557  glutamine amidotransferase class-II  26.64 
 
 		 595 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0217715 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  22.37 
 
 		 610 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.42 
 
 		 586 aa  43.9  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24 
 
 		 611 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4418  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.47 
 
 		 607 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>