70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0147 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
384 aa  786    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  40.05 
 
 
395 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  40.05 
 
 
395 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  39.05 
 
 
388 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  40.83 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  40.98 
 
 
390 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  40.8 
 
 
380 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  36.98 
 
 
397 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  40.72 
 
 
390 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  41.65 
 
 
388 aa  270  5e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  41.07 
 
 
377 aa  269  7e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  38.54 
 
 
384 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  38.54 
 
 
384 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  39.78 
 
 
384 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  38.54 
 
 
384 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  38.27 
 
 
384 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  38.27 
 
 
384 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  38.27 
 
 
384 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  39.3 
 
 
388 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  38.27 
 
 
384 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  40.05 
 
 
376 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  41.03 
 
 
388 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  41.03 
 
 
388 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  41.03 
 
 
388 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  36.43 
 
 
387 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  37.83 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  36.63 
 
 
384 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  34.39 
 
 
386 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  34.13 
 
 
386 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  34.13 
 
 
386 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  31.91 
 
 
384 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  27.2 
 
 
400 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  22.84 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  24.51 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.96 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  23.73 
 
 
317 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.26 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2686  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  21.39 
 
 
346 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.95 
 
 
609 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.95 
 
 
609 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.95 
 
 
609 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.66 
 
 
609 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.66 
 
 
609 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.66 
 
 
609 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.38 
 
 
609 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.66 
 
 
609 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.38 
 
 
609 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16620  predicted phosphosugar isomerase  24.81 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.816556  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5803  sugar isomerase (SIS)  23.31 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.16 
 
 
609 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2367  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  22.01 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.192922  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0557  glutamine amidotransferase class-II  22.89 
 
 
595 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0217715 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0903  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.14 
 
 
602 aa  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157355  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.28 
 
 
586 aa  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01970  predicted phosphosugar isomerase  23.97 
 
 
291 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.212959  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  22.19 
 
 
611 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.1 
 
 
609 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  32.76 
 
 
329 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2606  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.06 
 
 
608 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659057  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.23 
 
 
609 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.19 
 
 
609 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.08 
 
 
613 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.851914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.03 
 
 
609 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  21.81 
 
 
609 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.5 
 
 
610 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  21.07 
 
 
610 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3539  sugar isomerase (SIS)  22.34 
 
 
310 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632744  normal  0.722718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.06 
 
 
608 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0607297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.4 
 
 
608 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1166  phosphosugar isomerase-like protein  22.03 
 
 
290 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>