111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4453 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  98.96 
 
 
384 aa  788    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  98.96 
 
 
384 aa  787    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  80.21 
 
 
380 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  98.7 
 
 
384 aa  786    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  98.96 
 
 
384 aa  788    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  98.7 
 
 
384 aa  786    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  97.4 
 
 
384 aa  781    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  100 
 
 
384 aa  795    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  98.96 
 
 
384 aa  788    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  71.88 
 
 
384 aa  578  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  45.58 
 
 
388 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  45.58 
 
 
388 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  48.66 
 
 
388 aa  332  5e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  47.28 
 
 
387 aa  322  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  45.43 
 
 
386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  45.16 
 
 
386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  42.51 
 
 
388 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  45.16 
 
 
386 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  45.04 
 
 
397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  38.44 
 
 
395 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  38.44 
 
 
395 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  40.31 
 
 
377 aa  281  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  38.62 
 
 
390 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  40.79 
 
 
388 aa  280  4e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  38.62 
 
 
390 aa  279  7e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  41.42 
 
 
388 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  38.27 
 
 
384 aa  264  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  37.2 
 
 
376 aa  263  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  42.09 
 
 
384 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  40.94 
 
 
388 aa  251  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  40.48 
 
 
384 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  33.86 
 
 
400 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  23.86 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  27.76 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  28.92 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.22 
 
 
613 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  26.33 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2621  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.5 
 
 
630 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.204454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2658  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.2 
 
 
612 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.144051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4464  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.2 
 
 
612 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582003  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.16 
 
 
609 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1487  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.3 
 
 
609 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.53 
 
 
610 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2210  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.05 
 
 
609 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  22.48 
 
 
302 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2912  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.71 
 
 
630 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.379512  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1739  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.56 
 
 
628 aa  50.4  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15236  normal  0.181202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2611  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.66 
 
 
622 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0080  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.05 
 
 
614 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0166256  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2705  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.75 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0596845  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.61 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0089  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.52 
 
 
614 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  23.1 
 
 
610 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0832  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.18 
 
 
353 aa  47.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2605  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 
634 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.02871  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.9 
 
 
610 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4102  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.74 
 
 
611 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.66 
 
 
611 aa  46.6  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4564  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.56 
 
 
610 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4716  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.23 
 
 
605 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1899  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.75 
 
 
616 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.362507  normal  0.0290397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.8 
 
 
609 aa  46.6  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4261  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.56 
 
 
610 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  21.73 
 
 
591 aa  46.6  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3838  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.58 
 
 
611 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.73 
 
 
609 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4069  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.74 
 
 
611 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.321445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.73 
 
 
609 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.13 
 
 
617 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.44 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0004  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.92 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00308372  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.73 
 
 
609 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.73 
 
 
609 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.73 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.3 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1359  putative aminotransferase  26.42 
 
 
340 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.44 
 
 
609 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.09 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.44 
 
 
609 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2584  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.76 
 
 
616 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.946253  normal  0.069617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.44 
 
 
609 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  24.72 
 
 
611 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0619  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.73 
 
 
605 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247891  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.73 
 
 
609 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4198  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.36 
 
 
611 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3959  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  22.41 
 
 
611 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318136  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.89 
 
 
610 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1077  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  26.15 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.898822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.15 
 
 
610 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.44 
 
 
609 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1553  sugar isomerase (SIS)  22.8 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.38 
 
 
609 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.2 
 
 
614 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  27.75 
 
 
610 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0005  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.35 
 
 
575 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1085  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.91 
 
 
332 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000406537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1145  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.91 
 
 
332 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000959742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1179  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.91 
 
 
332 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000240195  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3210  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.91 
 
 
332 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00435546  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01415  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.34 
 
 
615 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>