28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6325 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  55.21 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  41.88 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  44.03 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  35.75 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  38.4 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  40 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  32.27 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  38.48 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  35.15 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1365  hypothetical protein  41.35 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  35.43 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  36.77 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  41.77 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  41.77 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  38.11 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  34.62 
 
 		 399 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  33.7 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  38.99 
 
 		 426 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  33.77 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  36.36 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  31.23 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  30.65 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  25.34 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  20.72 
 
 		 354 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  22.03 
 
 		 357 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>