24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1738 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  707    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  75.27 
 
 		 369 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1365  hypothetical protein  66.39 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  66.39 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  66.39 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  58.4 
 
 		 346 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  42.32 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  43.28 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  45.25 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  38.44 
 
 		 358 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  31.66 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  34.3 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  32.07 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  38.43 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  31.67 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  29.32 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  33.19 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  32.2 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  30.13 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  31.75 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  31.17 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  30.27 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>