More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2202 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
453 aa  904    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  70.93 
 
 
447 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  68.33 
 
 
450 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  62.14 
 
 
446 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  32.41 
 
 
449 aa  232  9e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  33.19 
 
 
477 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  39.13 
 
 
432 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  39.95 
 
 
473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  31.22 
 
 
439 aa  210  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  30.15 
 
 
437 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  30.36 
 
 
438 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  35.92 
 
 
464 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  29.62 
 
 
450 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  31.96 
 
 
479 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  34.02 
 
 
448 aa  206  8e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  34.02 
 
 
448 aa  206  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  30.07 
 
 
437 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  29.85 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  33.92 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  35.7 
 
 
437 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.29 
 
 
430 aa  193  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 
433 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  35.04 
 
 
430 aa  192  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  36.24 
 
 
441 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.57 
 
 
445 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.71 
 
 
435 aa  190  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  36.17 
 
 
468 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.98 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  35.22 
 
 
444 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  30.85 
 
 
405 aa  179  8e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  29.78 
 
 
434 aa  176  7e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  30.69 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  28.78 
 
 
407 aa  172  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  29.47 
 
 
405 aa  172  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2086  glucose-6-phosphate isomerase  36.56 
 
 
460 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732698  normal  0.0228263 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  27.82 
 
 
406 aa  172  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  27.58 
 
 
406 aa  170  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  32.02 
 
 
445 aa  168  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  27.58 
 
 
406 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  33.51 
 
 
448 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  30.95 
 
 
443 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  30.95 
 
 
443 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 
443 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  28.68 
 
 
401 aa  160  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  29.66 
 
 
450 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3509  glucose-6-phosphate isomerase  31.75 
 
 
450 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  29.86 
 
 
450 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  29.86 
 
 
450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  31.69 
 
 
424 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  29.62 
 
 
450 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  29.62 
 
 
450 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  28.48 
 
 
450 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  29.62 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  29.62 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3003  glucose-6-phosphate isomerase  30.85 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  29.62 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  28.79 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  29.33 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  29.62 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  29.62 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 
443 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 
443 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  32.37 
 
 
449 aa  153  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  28.84 
 
 
451 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  32.79 
 
 
450 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  31.32 
 
 
452 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  27.87 
 
 
446 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  30.67 
 
 
438 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  29.97 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  31.21 
 
 
431 aa  146  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  27.64 
 
 
449 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  29.07 
 
 
450 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0355  glucose-6-phosphate isomerase  30.13 
 
 
450 aa  144  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0241  glucose-6-phosphate isomerase  29.82 
 
 
449 aa  143  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000576365  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  27.12 
 
 
402 aa  143  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  28.42 
 
 
443 aa  143  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  27.82 
 
 
426 aa  143  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  27.98 
 
 
448 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2549  glucose-6-phosphate isomerase  29.33 
 
 
450 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  31.06 
 
 
530 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2470  glucose-6-phosphate isomerase  30.35 
 
 
448 aa  138  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1256  glucose-6-phosphate isomerase  30.47 
 
 
447 aa  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000664093  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  32.02 
 
 
515 aa  133  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 
533 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  32.69 
 
 
533 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  26.1 
 
 
427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl254  glucose-6-phosphate isomerase  29.67 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  32.45 
 
 
530 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  27.61 
 
 
450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  32.7 
 
 
525 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  31.94 
 
 
529 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  31.66 
 
 
530 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  30.69 
 
 
529 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  29.54 
 
 
505 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  31.99 
 
 
532 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  31.97 
 
 
552 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  30 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  31.84 
 
 
529 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  28.84 
 
 
552 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.37 
 
 
948 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>