230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5188 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  67.84 
 
 		 538 aa  657    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  100 
 
 		 539 aa  1054    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  58.32 
 
 		 555 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1836  phosphoglucose isomerase (PGI)  57.09 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6015  phosphoglucose isomerase (PGI)  55.96 
 
 		 542 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0253937  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2095  glucose-6-phosphate isomerase  56.93 
 
 		 545 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2212  phosphoglucose isomerase (PGI)  54.89 
 
 		 548 aa  519  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00695787  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11410  glucose-6-phosphate isomerase  57.52 
 
 		 533 aa  511  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1125  glucose-6-phosphate isomerase  57.37 
 
 		 542 aa  508  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1982  phosphoglucose isomerase  52.22 
 
 		 547 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.686812  normal  0.830711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2004  glucose-6-phosphate isomerase  55.2 
 
 		 544 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2056  phosphoglucose isomerase (PGI)  56.46 
 
 		 532 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.477851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2420  phosphoglucose isomerase (PGI)  53.29 
 
 		 534 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3318  phosphoglucose isomerase (PGI)  54.48 
 
 		 559 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3091  phosphoglucose isomerase (PGI)  54.34 
 
 		 555 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220877 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13190  glucose-6-phosphate isomerase  50.34 
 
 		 580 aa  432  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.248571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.1 
 
 		 948 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.8 
 
 		 950 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.97 
 
 		 950 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.18 
 
 		 941 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  39.62 
 
 		 920 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.7 
 
 		 955 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.37 
 
 		 941 aa  280  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.59 
 
 		 948 aa  279  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.1 
 
 		 940 aa  279  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1952  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.41 
 
 		 632 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.56 
 
 		 942 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.1 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.23 
 
 		 950 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  40.37 
 
 		 950 aa  267  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  35.13 
 
 		 568 aa  263  4e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.59 
 
 		 940 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.86 
 
 		 950 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.27 
 
 		 958 aa  256  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2211  phosphoglucose isomerase (PGI)  37.62 
 
 		 541 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00026679  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.87 
 
 		 965 aa  254  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0139  phosphoglucose isomerase (PGI)  33.76 
 
 		 572 aa  253  8.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.4 
 
 		 943 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00480  glucose-6-phosphate isomerase  34.38 
 
 		 577 aa  222  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  28.84 
 
 		 405 aa  121  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  28.17 
 
 		 434 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  25.91 
 
 		 407 aa  115  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  26.83 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  26.49 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 		 406 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  27.03 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  28.25 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  26.7 
 
 		 438 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  28.41 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  26.75 
 
 		 406 aa  109  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  24.93 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  26.57 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  25.35 
 
 		 439 aa  105  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  29.17 
 
 		 477 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  28.84 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  28.84 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  28.82 
 
 		 533 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  27.82 
 
 		 515 aa  100  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  27.61 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  28.85 
 
 		 432 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  35.07 
 
 		 525 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  37.36 
 
 		 431 aa  98.6  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  27.49 
 
 		 448 aa  97.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  27.58 
 
 		 448 aa  97.4  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  27 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 		 448 aa  95.1  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  27.71 
 
 		 479 aa  94.7  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 		 448 aa  94.7  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  27.21 
 
 		 526 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  30.42 
 
 		 445 aa  94  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  27.42 
 
 		 449 aa  94  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  28.1 
 
 		 441 aa  93.6  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  26.72 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  26.72 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  26.72 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  26.72 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  26.72 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  26.88 
 
 		 528 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  26.72 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  26.72 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  27.75 
 
 		 443 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  28.19 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  29.61 
 
 		 426 aa  92.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  27.75 
 
 		 443 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  28.45 
 
 		 446 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  28.12 
 
 		 449 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  29.7 
 
 		 451 aa  92  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  29.89 
 
 		 464 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  27.94 
 
 		 452 aa  90.9  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  37.26 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  31.54 
 
 		 402 aa  90.5  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  28.45 
 
 		 530 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  27.1 
 
 		 450 aa  89.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  35.8 
 
 		 473 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  29.27 
 
 		 422 aa  88.6  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  29.41 
 
 		 453 aa  88.6  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  27.46 
 
 		 530 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  30.71 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 552 aa  86.7  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>