213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2004 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2004  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 544 aa  1071    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2212  phosphoglucose isomerase (PGI)  59.35 
 
 		 548 aa  555  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00695787  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1982  phosphoglucose isomerase  56.81 
 
 		 547 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.686812  normal  0.830711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6015  phosphoglucose isomerase (PGI)  57.66 
 
 		 542 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0253937  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1125  glucose-6-phosphate isomerase  57.12 
 
 		 542 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3318  phosphoglucose isomerase (PGI)  56.91 
 
 		 559 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  55.76 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  55.93 
 
 		 538 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2420  phosphoglucose isomerase (PGI)  55.7 
 
 		 534 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3091  phosphoglucose isomerase (PGI)  57.52 
 
 		 555 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  54.84 
 
 		 555 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2056  phosphoglucose isomerase (PGI)  57.33 
 
 		 532 aa  482  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.477851  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11410  glucose-6-phosphate isomerase  54.28 
 
 		 533 aa  475  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1836  phosphoglucose isomerase (PGI)  51.31 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2095  glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 		 545 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13190  glucose-6-phosphate isomerase  50.44 
 
 		 580 aa  443  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.248571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2211  phosphoglucose isomerase (PGI)  41.79 
 
 		 541 aa  327  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00026679  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.27 
 
 		 955 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1952  phosphoglucose isomerase (PGI)  40.93 
 
 		 632 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.32 
 
 		 941 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.32 
 
 		 941 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  40.18 
 
 		 948 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.57 
 
 		 943 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  35.6 
 
 		 950 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.48 
 
 		 940 aa  300  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.27 
 
 		 948 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.18 
 
 		 942 aa  293  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.21 
 
 		 950 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  35.56 
 
 		 958 aa  290  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.87 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  35.63 
 
 		 950 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.95 
 
 		 950 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.33 
 
 		 940 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  39.39 
 
 		 920 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  38.34 
 
 		 568 aa  276  9e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.01 
 
 		 950 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.19 
 
 		 965 aa  257  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0139  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.3 
 
 		 572 aa  249  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00480  glucose-6-phosphate isomerase  34.19 
 
 		 577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  26.93 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  26.49 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  31.27 
 
 		 431 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  41.98 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  27.7 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  24.56 
 
 		 434 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  27.05 
 
 		 449 aa  109  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  33.06 
 
 		 405 aa  109  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  28.08 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  27.4 
 
 		 450 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  24.52 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  25.67 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 405 aa  106  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  31.4 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  28.67 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  25.53 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  25.78 
 
 		 443 aa  102  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  36.13 
 
 		 529 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  28.35 
 
 		 448 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  33.46 
 
 		 528 aa  99  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  34.15 
 
 		 525 aa  98.6  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  28.53 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  30.36 
 
 		 406 aa  97.8  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  28.53 
 
 		 448 aa  97.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  26.63 
 
 		 479 aa  97.8  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  29.4 
 
 		 444 aa  97.4  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  29.44 
 
 		 445 aa  97.1  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  30.1 
 
 		 445 aa  96.7  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  28.1 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 		 450 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 		 450 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  25.98 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  29.91 
 
 		 528 aa  94.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  28.21 
 
 		 450 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  28.81 
 
 		 526 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  33.2 
 
 		 422 aa  94.7  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  26.93 
 
 		 426 aa  94.7  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 		 450 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  30.06 
 
 		 435 aa  94  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  37.14 
 
 		 526 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  37.14 
 
 		 526 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  27.55 
 
 		 450 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  33.47 
 
 		 529 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  27.6 
 
 		 453 aa  92  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  32.77 
 
 		 448 aa  91.3  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  32.68 
 
 		 446 aa  91.3  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  33.2 
 
 		 468 aa  91.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  30.12 
 
 		 430 aa  90.5  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  26.77 
 
 		 450 aa  90.5  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  32.67 
 
 		 446 aa  90.5  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  23.73 
 
 		 406 aa  90.1  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  35.21 
 
 		 505 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  31.38 
 
 		 433 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  28.68 
 
 		 443 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  28.68 
 
 		 443 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  36.92 
 
 		 533 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>