More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3479 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  65.28 
 
 		 529 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  63.22 
 
 		 525 aa  649    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  61.99 
 
 		 526 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  67.11 
 
 		 529 aa  710    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  63.37 
 
 		 528 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 530 aa  1082    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  64.13 
 
 		 505 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  61.99 
 
 		 526 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  93.19 
 
 		 530 aa  1010    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  68.37 
 
 		 530 aa  737    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  62.74 
 
 		 529 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  59.24 
 
 		 526 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  59.69 
 
 		 533 aa  622  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  60.04 
 
 		 528 aa  623  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  58.86 
 
 		 528 aa  618  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  58.72 
 
 		 528 aa  616  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  56.3 
 
 		 533 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  59.81 
 
 		 529 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  55.32 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  53.27 
 
 		 536 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  54.87 
 
 		 552 aa  525  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  51.76 
 
 		 532 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  54.58 
 
 		 532 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  51.37 
 
 		 532 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 532 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  44.86 
 
 		 527 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  44.86 
 
 		 527 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  44.99 
 
 		 527 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  44.2 
 
 		 527 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  32.52 
 
 		 539 aa  203  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  32.06 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  35.54 
 
 		 479 aa  183  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  31.91 
 
 		 548 aa  183  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2573  glucose-6-phosphate isomerase  32.81 
 
 		 525 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00324462  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.61 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  33.26 
 
 		 547 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  31.84 
 
 		 549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  29.63 
 
 		 545 aa  180  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  30.66 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  35.95 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  30.84 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 		 549 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 		 549 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 		 549 aa  178  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 		 549 aa  178  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 		 549 aa  178  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 		 549 aa  178  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  30.61 
 
 		 549 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  31.13 
 
 		 548 aa  177  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  30.3 
 
 		 549 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  32.06 
 
 		 549 aa  177  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  30.3 
 
 		 549 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  30.3 
 
 		 549 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  34.22 
 
 		 450 aa  176  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  31.9 
 
 		 549 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  32.79 
 
 		 549 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  30.3 
 
 		 549 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  30.3 
 
 		 549 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  31.69 
 
 		 550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0755  glucose-6-phosphate isomerase  28.96 
 
 		 530 aa  173  5e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  31.4 
 
 		 550 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  30.41 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  30.59 
 
 		 550 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  32.4 
 
 		 542 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  32.28 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  33.89 
 
 		 437 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  32.9 
 
 		 548 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  32.53 
 
 		 562 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  30.57 
 
 		 550 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  31.7 
 
 		 556 aa  171  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  31.02 
 
 		 438 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  32.22 
 
 		 545 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.74 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  30.04 
 
 		 548 aa  170  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  30.04 
 
 		 548 aa  170  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  30.04 
 
 		 548 aa  170  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  33.11 
 
 		 547 aa  169  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1719  glucose-6-phosphate isomerase  33.55 
 
 		 539 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  32.82 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  32.82 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  29.16 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  34.41 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1849  glucose-6-phosphate isomerase  32.27 
 
 		 546 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  33.61 
 
 		 437 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0581  glucose-6-phosphate isomerase  34.86 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  31.54 
 
 		 531 aa  167  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  31.28 
 
 		 545 aa  167  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0657  glucose-6-phosphate isomerase  32.14 
 
 		 524 aa  166  9e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  31.41 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1103  glucose-6-phosphate isomerase  33.26 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  35.88 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  32.74 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  32.65 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  32.19 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  32.65 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  32.65 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  33.99 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  33.03 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  31.44 
 
 		 545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>