More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2902 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
477 aa  988    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  54.83 
 
 
479 aa  535  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  49.89 
 
 
464 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  47.2 
 
 
457 aa  418  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  49.13 
 
 
468 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  47.89 
 
 
453 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  46.58 
 
 
449 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  46.17 
 
 
448 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  46.17 
 
 
448 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  45.37 
 
 
450 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  46.8 
 
 
445 aa  343  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  47.41 
 
 
432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  40.88 
 
 
445 aa  322  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  43.78 
 
 
473 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  38.61 
 
 
434 aa  311  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  38.34 
 
 
437 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2086  glucose-6-phosphate isomerase  42.52 
 
 
460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732698  normal  0.0228263 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  38.24 
 
 
439 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  38.2 
 
 
437 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  37.17 
 
 
438 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  39.17 
 
 
430 aa  283  6.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  37.28 
 
 
448 aa  276  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  38.19 
 
 
450 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  38.19 
 
 
450 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3509  glucose-6-phosphate isomerase  38.57 
 
 
450 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  38.19 
 
 
450 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  38.19 
 
 
450 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  38.19 
 
 
450 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  38.19 
 
 
450 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  38.19 
 
 
450 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  38.19 
 
 
450 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  38.19 
 
 
450 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  37.73 
 
 
450 aa  263  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  36.96 
 
 
449 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3003  glucose-6-phosphate isomerase  36.05 
 
 
449 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  37.78 
 
 
430 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  34.76 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  35.03 
 
 
448 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  34.54 
 
 
450 aa  250  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.28 
 
 
435 aa  249  7e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  37.91 
 
 
441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  34.84 
 
 
449 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  36.01 
 
 
450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  36.14 
 
 
450 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  35.87 
 
 
451 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  35.43 
 
 
450 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  34.35 
 
 
443 aa  231  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  32.76 
 
 
447 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  36.11 
 
 
433 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0241  glucose-6-phosphate isomerase  33.62 
 
 
449 aa  228  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000576365  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  32.44 
 
 
443 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2549  glucose-6-phosphate isomerase  35.43 
 
 
450 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  32.99 
 
 
453 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0355  glucose-6-phosphate isomerase  33.48 
 
 
450 aa  223  6e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  32.87 
 
 
448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2470  glucose-6-phosphate isomerase  33.64 
 
 
448 aa  219  7e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  34.04 
 
 
405 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.74 
 
 
450 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  34.15 
 
 
407 aa  219  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  33.57 
 
 
445 aa  218  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  32.08 
 
 
443 aa  217  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  32.08 
 
 
443 aa  217  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  32.54 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  32.95 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  32.15 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  34.25 
 
 
446 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  31.1 
 
 
443 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  31.1 
 
 
443 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  35.07 
 
 
406 aa  207  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  32.92 
 
 
438 aa  206  6e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  35.62 
 
 
444 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
422 aa  204  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  34.11 
 
 
431 aa  203  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  33.1 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  33.72 
 
 
529 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  34.68 
 
 
525 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  31.78 
 
 
406 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1256  glucose-6-phosphate isomerase  32.33 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000664093  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 
401 aa  184  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  31.37 
 
 
406 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  31.54 
 
 
406 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  35.41 
 
 
515 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  32.72 
 
 
405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  32.35 
 
 
529 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  32.62 
 
 
529 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  36.59 
 
 
526 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  34.24 
 
 
402 aa  179  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  32.29 
 
 
527 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  33.49 
 
 
533 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  36.31 
 
 
528 aa  176  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  31.22 
 
 
533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  33.97 
 
 
532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  32.47 
 
 
528 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  36.89 
 
 
505 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  31.3 
 
 
528 aa  172  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  36.54 
 
 
532 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  34.68 
 
 
530 aa  170  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  35.42 
 
 
526 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  35.42 
 
 
526 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  33.7 
 
 
532 aa  170  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>