More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1975 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
515 aa  1055    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  58.84 
 
 
530 aa  561  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  58 
 
 
529 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  56.47 
 
 
526 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  58.72 
 
 
533 aa  551  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  57.77 
 
 
528 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  57.89 
 
 
505 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  58.06 
 
 
525 aa  549  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  56.29 
 
 
528 aa  543  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  55.32 
 
 
530 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  55.47 
 
 
526 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  55.47 
 
 
526 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  54.93 
 
 
530 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  58.4 
 
 
529 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  56.16 
 
 
528 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  54.26 
 
 
528 aa  522  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  54.74 
 
 
529 aa  521  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  55.18 
 
 
529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  54.43 
 
 
552 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  52.66 
 
 
532 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  50.51 
 
 
533 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  50.4 
 
 
536 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  48.47 
 
 
532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  47.03 
 
 
532 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  45.81 
 
 
527 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  46.01 
 
 
527 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  44.97 
 
 
527 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  45.56 
 
 
527 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  46.25 
 
 
532 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  35.41 
 
 
477 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  35.73 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  30.02 
 
 
539 aa  177  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  31.1 
 
 
545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  31.6 
 
 
540 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  32.67 
 
 
434 aa  172  9e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  31.67 
 
 
437 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.2 
 
 
445 aa  170  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  30.05 
 
 
438 aa  170  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  31.55 
 
 
437 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  32.4 
 
 
540 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  32.4 
 
 
540 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  32.4 
 
 
540 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  32.4 
 
 
540 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2573  glucose-6-phosphate isomerase  30.82 
 
 
525 aa  166  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00324462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  30.95 
 
 
547 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  32.73 
 
 
540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  30.38 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  31.79 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  32.2 
 
 
540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  32.14 
 
 
540 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  34.05 
 
 
464 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  31.82 
 
 
457 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  32.35 
 
 
556 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  32.2 
 
 
540 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  32.14 
 
 
556 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  32.14 
 
 
556 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  32.18 
 
 
540 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  31.42 
 
 
547 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  32.26 
 
 
453 aa  162  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  31.14 
 
 
545 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  31.18 
 
 
448 aa  161  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  31.18 
 
 
448 aa  161  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  30.71 
 
 
545 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1849  glucose-6-phosphate isomerase  30.82 
 
 
546 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  31.55 
 
 
545 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  31.14 
 
 
545 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  31.91 
 
 
540 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  33.05 
 
 
430 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  31.36 
 
 
545 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  31.91 
 
 
556 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  30.75 
 
 
545 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  33.96 
 
 
473 aa  160  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  32.42 
 
 
552 aa  160  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  33.52 
 
 
437 aa  160  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0782  Glucose-6-phosphate isomerase  31.05 
 
 
496 aa  159  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  31.14 
 
 
545 aa  159  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  29.4 
 
 
547 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  29.52 
 
 
545 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  29.9 
 
 
549 aa  159  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  31.49 
 
 
545 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  28.85 
 
 
545 aa  158  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  30.54 
 
 
545 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  31.35 
 
 
545 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  31.89 
 
 
615 aa  158  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  30.78 
 
 
562 aa  157  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  32.12 
 
 
542 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  29.64 
 
 
545 aa  156  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  30.02 
 
 
540 aa  156  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  31.04 
 
 
545 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  32.31 
 
 
560 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  35.03 
 
 
468 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0755  glucose-6-phosphate isomerase  28.36 
 
 
530 aa  155  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  31.37 
 
 
547 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.22 
 
 
445 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  30.23 
 
 
540 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  32.19 
 
 
559 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  33.24 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  31 
 
 
550 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  28.32 
 
 
550 aa  153  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  30.79 
 
 
550 aa  153  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>