More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1019 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  84.26 
 
 
540 aa  956    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  84.39 
 
 
540 aa  949    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  87.88 
 
 
540 aa  982    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  84.39 
 
 
540 aa  949    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
540 aa  1119    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  84.01 
 
 
540 aa  945    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  84.26 
 
 
556 aa  959    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  84.39 
 
 
540 aa  949    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  84.2 
 
 
540 aa  947    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  83.27 
 
 
615 aa  940    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  85 
 
 
540 aa  961    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  87.31 
 
 
540 aa  976    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  84.63 
 
 
556 aa  957    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  84.81 
 
 
540 aa  940    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  84.26 
 
 
556 aa  956    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  84.01 
 
 
540 aa  944    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  84.63 
 
 
556 aa  957    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  84.39 
 
 
540 aa  949    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  57.14 
 
 
545 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1861  glucose-6-phosphate isomerase  56.48 
 
 
539 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000375128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  57.25 
 
 
541 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  56.16 
 
 
649 aa  608  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1528  glucose-6-phosphate isomerase  55.56 
 
 
539 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1719  glucose-6-phosphate isomerase  55.29 
 
 
539 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  54.33 
 
 
548 aa  586  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  54.65 
 
 
542 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  53.93 
 
 
549 aa  570  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  51.54 
 
 
548 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  53.26 
 
 
546 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  53.33 
 
 
546 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  52.22 
 
 
543 aa  561  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  51.82 
 
 
548 aa  559  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  52.04 
 
 
543 aa  561  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  51.09 
 
 
552 aa  558  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  51.37 
 
 
562 aa  556  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  52.3 
 
 
541 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  51.48 
 
 
560 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  52.42 
 
 
550 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  52.79 
 
 
546 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  51.47 
 
 
548 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 
547 aa  548  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  53.14 
 
 
531 aa  551  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  49.36 
 
 
567 aa  550  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  50.27 
 
 
539 aa  549  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  50.82 
 
 
559 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  50.27 
 
 
547 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  52.87 
 
 
546 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  53.31 
 
 
547 aa  545  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  48.45 
 
 
549 aa  543  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  48.53 
 
 
548 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 
549 aa  542  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 
552 aa  539  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  51.19 
 
 
550 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  50.75 
 
 
549 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  50.83 
 
 
551 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 
549 aa  532  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  50.83 
 
 
548 aa  535  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  50.64 
 
 
549 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 
549 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  52.4 
 
 
556 aa  534  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 
549 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  50.64 
 
 
554 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  48.15 
 
 
545 aa  531  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 
550 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  50.64 
 
 
554 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 
549 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 
549 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 
549 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  50.64 
 
 
554 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 
549 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 
548 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  50.37 
 
 
549 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 
549 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
549 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
549 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 
549 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
549 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 
548 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
549 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
549 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  49.36 
 
 
543 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 
545 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
549 aa  527  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 
548 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 
545 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 
548 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  49.45 
 
 
550 aa  525  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  49.35 
 
 
556 aa  524  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  48.98 
 
 
545 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  47.58 
 
 
547 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  48.98 
 
 
549 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  48.8 
 
 
550 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  48.98 
 
 
545 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
550 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  48.71 
 
 
550 aa  525  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  48.98 
 
 
545 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  50.74 
 
 
549 aa  521  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  48.51 
 
 
547 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  47.62 
 
 
545 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 
547 aa  519  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>