More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00012 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  76.87 
 
 		 549 aa  906    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  76.68 
 
 		 549 aa  904    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  64.27 
 
 		 548 aa  750    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  58.75 
 
 		 546 aa  677    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  76.68 
 
 		 549 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  76.87 
 
 		 549 aa  906    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  59.51 
 
 		 541 aa  659    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  95.09 
 
 		 550 aa  1091    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  76.68 
 
 		 549 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  71.22 
 
 		 548 aa  815    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  59.78 
 
 		 556 aa  661    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  62.27 
 
 		 539 aa  699    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  85.27 
 
 		 550 aa  996    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  66.42 
 
 		 554 aa  750    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  76.68 
 
 		 549 aa  904    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  61.24 
 
 		 560 aa  688    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  62.55 
 
 		 549 aa  706    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  77.01 
 
 		 548 aa  900    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  60.22 
 
 		 549 aa  686    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  60.59 
 
 		 552 aa  690    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  76.87 
 
 		 549 aa  906    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  60.26 
 
 		 548 aa  685    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  76.32 
 
 		 549 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  76.64 
 
 		 549 aa  898    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  76.87 
 
 		 550 aa  890    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  62.45 
 
 		 547 aa  685    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  61.57 
 
 		 547 aa  696    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  61.21 
 
 		 547 aa  683    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  77.6 
 
 		 549 aa  897    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  62.29 
 
 		 531 aa  689    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  77.01 
 
 		 548 aa  900    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  76.87 
 
 		 549 aa  906    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  77.19 
 
 		 548 aa  906    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  66.97 
 
 		 553 aa  795    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  70 
 
 		 549 aa  804    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  58.56 
 
 		 562 aa  676    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  77.05 
 
 		 549 aa  909    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  76.64 
 
 		 549 aa  899    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  71.38 
 
 		 567 aa  810    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  74.32 
 
 		 549 aa  862    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  77.01 
 
 		 548 aa  900    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  87.45 
 
 		 550 aa  1025    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  61.21 
 
 		 545 aa  694    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  70.55 
 
 		 550 aa  807    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  76.5 
 
 		 549 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  69.87 
 
 		 550 aa  814    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  63.24 
 
 		 547 aa  717    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  76.87 
 
 		 549 aa  905    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  61.3 
 
 		 548 aa  696    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  58.75 
 
 		 559 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  76.87 
 
 		 549 aa  906    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  76.73 
 
 		 550 aa  875    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  70.42 
 
 		 552 aa  808    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  77.05 
 
 		 549 aa  909    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 550 aa  1138    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  76.68 
 
 		 549 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  54.93 
 
 		 548 aa  629  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  55 
 
 		 545 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  55.56 
 
 		 551 aa  617  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  54.51 
 
 		 545 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  54.78 
 
 		 545 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  56.54 
 
 		 548 aa  612  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  54.33 
 
 		 545 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  54.33 
 
 		 545 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  54.6 
 
 		 547 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  54.26 
 
 		 545 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  53.59 
 
 		 545 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84923  phosphoglucoisomerase  58.76 
 
 		 553 aa  613  9.999999999999999e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.154814 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  54.81 
 
 		 550 aa  609  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  54.14 
 
 		 545 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  55.54 
 
 		 649 aa  608  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  56.39 
 
 		 546 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  53.96 
 
 		 545 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  53.78 
 
 		 545 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  54.78 
 
 		 543 aa  608  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  54.26 
 
 		 545 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  53.78 
 
 		 545 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  53.78 
 
 		 545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  55.37 
 
 		 545 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  52.1 
 
 		 548 aa  599  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  54.41 
 
 		 543 aa  598  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  53.04 
 
 		 545 aa  597  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1184  glucose-6-phosphate isomerase  53.59 
 
 		 545 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00253768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  52.89 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06037  phosphoglucose isomerase SwoM/PgiA (Eurofung)  59.01 
 
 		 553 aa  588  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0281434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  51.2 
 
 		 554 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  53.68 
 
 		 549 aa  587  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  53.86 
 
 		 546 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  53.76 
 
 		 546 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  51.02 
 
 		 554 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  51.2 
 
 		 554 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  51.02 
 
 		 554 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  51.02 
 
 		 554 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  51.02 
 
 		 554 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  52.73 
 
 		 550 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  53.08 
 
 		 561 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  51.35 
 
 		 569 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  53.61 
 
 		 541 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  52.22 
 
 		 547 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 		 554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>